Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G186800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNC6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.004G186800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G011600 glutathione S-transferase, putative, expressed -
2 Sobic.003G064901 - -
3 Sobic.004G091900 - -
4 Sobic.003G369566 - -
5 Sobic.003G369533 - -
6 Sobic.001G098700 GRAM domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
8 Sobic.001G278650 - -
9 Sobic.003G160433 - -
10 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G358366 - -
12 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
13 Sobic.003G160300 - -
14 Sobic.005G116400 apocytochrome f precursor, putative, expressed K02634: apocytochrome f
15 Sobic.002G311900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G137501 - -
17 Sobic.005G096450 - -
18 Sobic.003G330350 - -
19 Sobic.002G380550 - -
20 Sobic.007G149200 "DEP1/GGC2(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659905)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G186800 Sobic004G186800 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic004G186800--Sobic001G011600 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G186800--Sobic003G064901 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic004G186800--Sobic004G091900 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic004G186800--Sobic003G369566 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic004G186800--Sobic003G369533 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic004G186800--Sobic001G098700 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic004G186800--Sobic003G169000 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic004G186800--Sobic001G278650 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic004G186800--Sobic003G160433 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic001G011600--Sobic010G225400 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic001G011600--Sobic006G130100 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic001G011600--Sobic003G218950 Sobic001G011600--Sobic003G369566 Sobic007G137501 Sobic007G137501 Sobic001G011600--Sobic007G137501 Sobic001G011600--Sobic003G369533 Sobic001G519700 Sobic001G519700 Sobic001G011600--Sobic001G519700 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic001G011600--Sobic005G116400 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic001G011600--Sobic003G050100 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic003G064901--Sobic009G102250 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic003G064901--Sobic002G138400 Sobic003G064901--Sobic004G091900 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic003G064901--Sobic001G270800 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic003G064901--Sobic001G167000 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic003G064901--Sobic001G182700 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic003G064901--Sobic004G032200 Sobic003G064901--Sobic007G137501 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic003G064901--Sobic001G182800 Sobic004G091900--Sobic003G064901 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic004G091900--Sobic008G007500 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic004G091900--Sobic003G330350 Sobic004G091900--Sobic001G270800 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic004G091900--Sobic002G087700 Sobic010G065001 Sobic010G065001 Sobic004G091900--Sobic010G065001 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic004G091900--Sobic010G193100 Sobic004G091900--Sobic001G098700 Sobic004G091900--Sobic001G011600 Sobic003G369566--Sobic003G369533 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G369566--Sobic007G149200 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G369566--Sobic003G168200 Sobic002G311900 Sobic002G311900 Sobic003G369566--Sobic002G311900 Sobic003G369566--Sobic005G116400 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic003G369566--Sobic003G169100 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G369566--Sobic003G352000 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G369566--SobicK029400 Sobic003G369566--Sobic003G169000 Sobic003G369533--SobicK029400 Sobic003G369533--Sobic003G218950 Sobic003G369533--Sobic003G168200 Sobic003G369533--Sobic007G149200 Sobic003G369533--Sobic005G116400 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic003G369533--Sobic007G065000 Sobic003G369533--Sobic003G352000 Sobic003G369533--Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G169000 Sobic001G098700--Sobic003G330350 Sobic001G098700--Sobic003G050100 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic001G098700--Sobic006G057100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G098700--Sobic009G192200 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G098700--Sobic003G233266 Sobic001G098700--Sobic001G270800 Sobic001G098700--Sobic003G218950 Sobic001G098700--Sobic003G169000 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic001G098700--Sobic006G131700 Sobic003G169000--Sobic003G169100 Sobic003G169000--Sobic007G065000 Sobic003G169000--Sobic007G149200 Sobic003G169000--Sobic003G352000 Sobic003G169000--Sobic003G369533 Sobic003G169000--Sobic003G168200 Sobic003G169000--SobicK029400 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic003G169000--Sobic007G145801 Sobic003G169000--Sobic003G218950 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic001G278650--Sobic001G171700 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic001G278650--Sobic004G322650 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic001G278650--Sobic010G267300 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic001G278650--Sobic001G182900 Sobic001G278650--Sobic003G160433 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic001G278650--Sobic005G216900 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G278650--Sobic001G358366 Sobic004G015600 Sobic004G015600 Sobic001G278650--Sobic004G015600 Sobic001G278650--Sobic003G369533 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G160433--Sobic003G160300 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G160433--Sobic002G390200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic007G085900 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic003G160433--Sobic001G128000 Sobic003G160433--Sobic005G216900 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic003G160433--Sobic002G180732 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G160433--Sobic003G160400 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic001G054050 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G160433--Sobic008G140050
Octagon: transcription factors


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