Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G278650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8G6
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF315
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G41220 : glutathione S-transferase THETA 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g12950.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
2 Sobic.004G322650 - -
3 Sobic.010G267300 thaumatin, putative, expressed -
4 Sobic.001G182900 - -
5 Sobic.003G160433 - -
6 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G358366 - -
8 Sobic.004G015600 - -
9 Sobic.003G369533 - -
10 Sobic.002G380550 - -
11 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
12 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
13 Sobic.003G160300 - -
14 Sobic.005G116400 apocytochrome f precursor, putative, expressed K02634: apocytochrome f
15 Sobic.001G128000 expressed protein -
16 Sobic.002G083332 - -
17 Sobic.002G180732 - -
18 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
19 Sobic.005G163932 - -
20 Sobic.010G185250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic001G278650--Sobic001G171700 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic001G278650--Sobic004G322650 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic001G278650--Sobic010G267300 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic001G278650--Sobic001G182900 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic001G278650--Sobic003G160433 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic001G278650--Sobic005G216900 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G278650--Sobic001G358366 Sobic004G015600 Sobic004G015600 Sobic001G278650--Sobic004G015600 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic001G278650--Sobic003G369533 Sobic001G171700--Sobic001G278650 Sobic001G171700--Sobic004G322650 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G171700--Sobic008G171200 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic001G171700--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic001G171700--Sobic009G204501 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic001G171700--Sobic002G380550 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic001G171700--Sobic006G035200 Sobic001G171700--Sobic001G358366 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic001G171700--Sobic004G157050 Sobic004G322650--Sobic008G171200 Sobic004G322650--Sobic001G171700 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G322650--Sobic003G238750 Sobic004G322650--Sobic001G278650 Sobic004G322650--Sobic004G157050 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G322650--Sobic001G476800 Sobic004G322650--Sobic001G182900 Sobic004G322650--Sobic005G216900 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic004G322650--Sobic002G157050 Sobic010G267300--Sobic003G160433 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic010G267300--Sobic001G128000 Sobic010G267300--Sobic008G171200 Sobic010G267300--Sobic005G216900 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic010G267300--Sobic007G065000 Sobic010G267300--Sobic004G157050 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic010G267300--Sobic003G160300 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic010G267300--Sobic007G085900 Sobic010G267300--Sobic001G182900 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic001G182900--Sobic010G185250 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G182900--Sobic010G035600 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic001G182900--Sobic002G165200 Sobic001G182900--Sobic003G369533 Sobic001G182900--Sobic007G065000 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G182900--Sobic001G182800 SobicK029400 SobicK029400 Sobic001G182900--SobicK029400 Sobic001G182900--Sobic001G476800 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic001G182900--Sobic003G218950 Sobic003G160433--Sobic003G160300 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G160433--Sobic002G390200 Sobic003G160433--Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic001G128000 Sobic003G160433--Sobic005G216900 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic003G160433--Sobic002G180732 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G160433--Sobic003G160400 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic001G054050 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G160433--Sobic008G140050 Sobic005G216900--Sobic003G160400 Sobic005G216900--Sobic003G160433 Sobic005G216900--Sobic003G160300 Sobic005G216900--Sobic007G085900 Sobic005G216900--Sobic001G128000 Sobic005G216900--Sobic001G054050 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic005G216900--Sobic006G057100 Sobic005G216900--Sobic002G390200 Sobic005G216900--SobicK029400 Sobic001G358366--Sobic007G065000 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic001G358366--Sobic002G083332 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic001G358366--Sobic002G159750 Sobic001G358366--Sobic001G182900 Sobic001G358366--Sobic001G182800 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic001G358366--Sobic010G206600 Sobic001G358366--Sobic008G171200 Sobic001G358366--Sobic010G035600 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G358366--Sobic001G394532 Sobic004G015600--Sobic001G394532 Sobic005G184900 Sobic005G184900 Sobic004G015600--Sobic005G184900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic004G015600--Sobic004G303433 Sobic004G015600--Sobic001G182900 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G015600--Sobic003G286450 Sobic004G015600--Sobic001G278650 Sobic004G015600--Sobic002G159750 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G015600--Sobic001G535850 Sobic004G015600--Sobic001G171700 Sobic003G369533--SobicK029400 Sobic003G369533--Sobic003G218950 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G369533--Sobic003G168200 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G369533--Sobic007G149200 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic007G065000 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G369533--Sobic003G352000 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G369566 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G369533--Sobic003G169000
Octagon: transcription factors


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