Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G098700.1
Synonym Sb01g008820, FIP1
Functional annotation GRAM domain containing protein, expressed
UniProt C5X1C4
Pfam PF02893
Panther DB PTHR31969 PTHR31969:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22475 : GRAM domain family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g52670.1 : GRAM domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016857
Brachypodium KQK13333
Barley HORVU4Hr1G011100.5 , HORVU4Hr1G011100.4 , HORVU4Hr1G011100.1 , HORVU4Hr1G011100.3 , HORVU4Hr1G011100.2
Wheat TraesCS4D02G066300 , TraesCS4A02G247500 , TraesCS4A02G247500 , TraesCS4B02G067400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G098700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.008G140050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic001G098700--Sobic003G330350 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic001G098700--Sobic003G050100 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic001G098700--Sobic006G057100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G098700--Sobic009G192200 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G098700--Sobic003G233266 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic001G098700--Sobic001G270800 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic001G098700--Sobic003G218950 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic001G098700--Sobic003G169000 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic001G098700--Sobic006G131700 Sobic003G330350--Sobic001G270800 Sobic003G330350--Sobic003G050100 Sobic003G330350--Sobic006G131700 Sobic003G330350--Sobic003G218950 Sobic003G330350--Sobic001G098700 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic003G330350--Sobic004G091900 Sobic003G330350--Sobic006G057100 Sobic003G330350--Sobic009G192200 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic003G330350--Sobic001G167000 Sobic003G050100--Sobic003G330350 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G050100--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G050100--Sobic003G160433 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G050100--Sobic007G085900 Sobic003G050100--Sobic006G057100 Sobic003G050100--Sobic009G192200 Sobic003G050100--Sobic003G218950 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G050100--Sobic005G216900 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G050100--Sobic002G390200 Sobic006G057100--Sobic003G218950 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic007G085900 SobicK029400 SobicK029400 Sobic006G057100--SobicK029400 Sobic006G057100--Sobic006G131700 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic006G057100--Sobic003G113100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic006G057100--Sobic003G369533 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G057100--Sobic003G160400 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic006G057100--Sobic010G185250 Sobic009G192200--Sobic007G085900 Sobic009G192200--Sobic006G057100 Sobic009G192200--Sobic003G160300 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic004G282933 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic009G192200--Sobic008G140050 Sobic009G192200--Sobic003G218950 Sobic009G192200--Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic006G131700 Sobic009G192200--Sobic003G352000 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic003G233266--Sobic001G331650 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic003G233266--Sobic008G040501 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic003G233266--Sobic004G207800 Sobic003G233266--Sobic003G169000 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic003G233266--Sobic009G101500 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic003G233266--Sobic001G300301 Sobic001G048500 Sobic001G048500 Sobic003G233266--Sobic001G048500 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic003G233266--Sobic001G502801 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic003G233266--Sobic004G077700 Sobic001G270800--Sobic003G330350 Sobic009G175700 Sobic009G175700 Sobic001G270800--Sobic009G175700 Sobic001G270800--Sobic001G167000 Sobic001G270800--Sobic004G091900 Sobic001G270800--Sobic006G131700 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic001G270800--Sobic003G064901 Sobic001G270800--Sobic003G169000 Sobic001G270800--Sobic003G233266 Sobic001G270800--Sobic009G101500 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G218950--Sobic003G352000 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G218950--Sobic003G169000 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic003G169000--Sobic003G169100 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic003G169000--Sobic007G065000 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G169000--Sobic007G149200 Sobic003G169000--Sobic003G352000 Sobic003G169000--Sobic003G369533 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G169000--Sobic003G168200 Sobic003G169000--SobicK029400 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic003G169000--Sobic007G145801 Sobic003G169000--Sobic003G218950 Sobic006G131700--Sobic003G218950 Sobic006G131700--Sobic003G113100 Sobic006G131700--Sobic006G057100 Sobic006G131700--Sobic009G101500 Sobic006G131700--Sobic003G330350 Sobic006G131700--Sobic009G192200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic006G131700--Sobic004G337850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic002G165200
Octagon: transcription factors


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