Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G401300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q7S8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68610.1 : pentatricopeptide repeat protein PPR1106-17, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G192200 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
2 Sobic.003G233266 - -
3 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
4 Sobic.001G331650 - -
5 Sobic.005G028500 expressed protein -
6 Sobic.001G048500 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed -
7 Sobic.004G337850 - -
8 Sobic.006G057100 - -
9 Sobic.003G352000 growth regulator related protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G098700 GRAM domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G330350 - -
12 Sobic.003G218950 - -
13 Sobic.007G085900 - -
14 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G101500 - -
16 Sobic.004G207800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
18 Sobic.008G140050 - -
19 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
20 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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