Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G353650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQH7
Pfam PF00249
Panther DB PTHR10641 PTHR10641:SF660
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G67300 : myb domain protein r1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g25370.1 : myb-like DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G193100 expressed protein -
2 Sobic.005G199151 - -
3 Sobic.006G249900 MBTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
5 Sobic.004G157050 - -
6 Sobic.003G160433 - -
7 Sobic.002G380550 - -
8 Sobic.010G267300 thaumatin, putative, expressed -
9 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G035200 - -
11 Sobic.004G351000 - -
12 Sobic.001G278650 - -
13 Sobic.001G331650 - -
14 Sobic.003G160300 - -
15 Sobic.002G087700 - -
16 Sobic.004G091900 - -
17 Sobic.002G180732 - -
18 Sobic.008G029000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY40, expressed -
19 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.001G488800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic004G353650 Sobic004G353650 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic004G353650--Sobic010G193100 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic004G353650--Sobic005G199151 Sobic006G249900 Sobic006G249900 Sobic004G353650--Sobic006G249900 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic004G353650--Sobic001G171700 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic004G353650--Sobic004G157050 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic004G353650--Sobic003G160433 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic004G353650--Sobic002G380550 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic004G353650--Sobic010G267300 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic004G353650--Sobic001G465600 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic010G193100--Sobic008G029000 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic010G193100--Sobic002G190600 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic010G193100--Sobic006G202900 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic010G193100--Sobic010G018200 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic010G193100--Sobic008G007500 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic010G193100--Sobic004G091900 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic010G193100--Sobic003G192500 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G193100--Sobic005G065050 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic010G193100--Sobic005G119250 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic005G199151--Sobic004G351000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic005G199151--Sobic002G180732 Sobic005G199151--Sobic008G029000 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic005G199151--Sobic002G232300 Sobic005G199151--Sobic010G018200 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic005G199151--Sobic005G187800 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic005G199151--Sobic009G087480 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic005G199151--Sobic001G259850 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic005G199151--Sobic002G390200 Sobic006G249900--Sobic005G199151 Sobic006G249900--Sobic004G353650 Sobic006G249900--Sobic004G351000 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic006G249900--Sobic003G081200 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic006G249900--Sobic006G035200 Sobic006G249900--Sobic004G157050 Sobic001G526050 Sobic001G526050 Sobic006G249900--Sobic001G526050 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic006G249900--Sobic001G488800 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic006G249900--Sobic009G147450 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic001G171700--Sobic001G278650 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic001G171700--Sobic004G322650 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G171700--Sobic008G171200 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic001G171700--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic001G171700--Sobic009G204501 Sobic001G171700--Sobic002G380550 Sobic001G171700--Sobic006G035200 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic004G157050 Sobic004G157050--Sobic008G171200 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic004G157050--Sobic007G113566 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic004G157050--Sobic010G002301 Sobic004G157050--Sobic001G465600 Sobic004G157050--Sobic003G160433 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G157050--Sobic001G476800 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic004G157050--Sobic001G128000 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic004G157050--Sobic001G331650 Sobic004G157050--Sobic010G267300 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G160433--Sobic003G160300 Sobic003G160433--Sobic002G390200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic001G128000 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160433--Sobic005G216900 Sobic003G160433--Sobic002G180732 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G160433--Sobic003G160400 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic001G054050 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G160433--Sobic008G140050 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic002G380550--Sobic002G083332 Sobic002G380550--Sobic009G204501 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G380550--Sobic003G056200 Sobic002G380550--Sobic001G358366 Sobic002G380550--Sobic001G171700 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic002G380550--Sobic004G126050 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic002G380550--Sobic003G172966 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic002G380550--Sobic007G065000 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic002G380550--Sobic001G530201 Sobic010G267300--Sobic003G160433 Sobic010G267300--Sobic001G128000 Sobic010G267300--Sobic008G171200 Sobic010G267300--Sobic005G216900 Sobic010G267300--Sobic007G065000 Sobic010G267300--Sobic004G157050 Sobic010G267300--Sobic003G160300 Sobic010G267300--Sobic007G085900 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G267300--Sobic001G182900 Sobic001G465600--Sobic010G002301 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G465600--Sobic003G139600 Sobic001G465600--Sobic001G331650 Sobic001G465600--Sobic004G157050 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G465600--Sobic004G207800 Sobic001G465600--Sobic007G113566 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic001G465600--Sobic006G219400 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic001G465600--Sobic002G191900 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G465600--Sobic001G201933
Octagon: transcription factors


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