Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G249900.1
Synonym BPM2, Sb06g031510, ATBPM2
Functional annotation MBTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt C5Y9K8
Pfam PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF155
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06190 : BTB-POZ and MATH domain 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56460.1 : MBTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G199151 - -
2 Sobic.004G353650 - -
3 Sobic.004G351000 - -
4 Sobic.003G081200 expressed protein -
5 Sobic.006G035200 - -
6 Sobic.004G157050 - -
7 Sobic.001G526050 - -
8 Sobic.001G488800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
9 Sobic.009G147450 - -
10 Sobic.002G191900 OsFBX325 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G232300 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR15 - Auxin-responsive SAUR gene family member -
12 Sobic.010G018200 expressed protein -
13 Sobic.010G002301 - -
14 Sobic.002G180732 - -
15 Sobic.001G343700 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G172633 - -
18 Sobic.002G157050 - -
19 Sobic.010G193100 expressed protein -
20 Sobic.002G292000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G249900 Sobic006G249900 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic006G249900--Sobic005G199151 Sobic004G353650 Sobic004G353650 Sobic006G249900--Sobic004G353650 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic006G249900--Sobic004G351000 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic006G249900--Sobic003G081200 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic006G249900--Sobic006G035200 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic006G249900--Sobic004G157050 Sobic001G526050 Sobic001G526050 Sobic006G249900--Sobic001G526050 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic006G249900--Sobic001G488800 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic006G249900--Sobic009G147450 Sobic005G199151--Sobic004G351000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic005G199151--Sobic002G180732 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic005G199151--Sobic008G029000 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic005G199151--Sobic002G232300 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic005G199151--Sobic010G018200 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic005G199151--Sobic005G187800 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic005G199151--Sobic009G087480 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic005G199151--Sobic001G259850 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic005G199151--Sobic002G390200 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic004G353650--Sobic010G193100 Sobic004G353650--Sobic005G199151 Sobic004G353650--Sobic006G249900 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic004G353650--Sobic001G171700 Sobic004G353650--Sobic004G157050 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic004G353650--Sobic003G160433 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic004G353650--Sobic002G380550 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic004G353650--Sobic010G267300 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic004G353650--Sobic001G465600 Sobic004G351000--Sobic005G199151 Sobic004G351000--Sobic002G232300 Sobic004G351000--Sobic008G029000 Sobic004G351000--Sobic001G259850 Sobic004G351000--Sobic010G018200 Sobic004G351000--Sobic002G180732 Sobic004G351000--Sobic005G187800 Sobic001G343700 Sobic001G343700 Sobic004G351000--Sobic001G343700 Sobic004G351000--Sobic009G087480 Sobic003G081200--Sobic009G147450 Sobic003G081200--Sobic001G343700 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic003G081200--Sobic004G024350 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic003G081200--Sobic004G230000 Sobic006G035200--Sobic001G171700 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic006G035200--Sobic001G278650 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic006G035200--Sobic002G157050 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic006G035200--Sobic004G322650 Sobic006G035200--Sobic004G157050 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic006G035200--Sobic008G171200 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic006G035200--Sobic003G139600 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic006G035200--Sobic004G282966 Sobic006G035200--Sobic002G380550 Sobic004G157050--Sobic008G171200 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic004G157050--Sobic007G113566 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic004G157050--Sobic010G002301 Sobic004G157050--Sobic001G465600 Sobic004G157050--Sobic003G160433 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G157050--Sobic001G476800 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic004G157050--Sobic001G128000 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic004G157050--Sobic001G331650 Sobic004G157050--Sobic010G267300 Sobic001G526050--Sobic001G343700 Sobic003G023901 Sobic003G023901 Sobic001G526050--Sobic003G023901 Sobic001G526050--Sobic003G081200 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic001G526050--Sobic001G315300 Sobic001G526050--Sobic009G147450 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic001G526050--Sobic002G109900 Sobic001G526050--Sobic004G351000 Sobic001G526050--Sobic002G232300 Sobic001G072550 Sobic001G072550 Sobic001G526050--Sobic001G072550 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic001G488800--Sobic001G505066 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic001G488800--Sobic009G124100 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic001G488800--Sobic001G035700 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic001G488800--Sobic002G310400 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G488800--Sobic004G104250 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic001G488800--Sobic005G065050 Sobic001G488800--Sobic010G018200 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic001G488800--Sobic010G081950 Sobic001G488800--Sobic009G147450 Sobic009G147450--Sobic005G065050 Sobic009G147450--Sobic003G081200 Sobic009G147450--Sobic010G018200 Sobic009G147450--Sobic004G024350 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic009G147450--Sobic001G423666 Sobic009G147450--Sobic004G230000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.