Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G450900.1
Synonym Sb01g042390
Functional annotation UNE2, putative, expressed
UniProt C5WSM3
Pfam PF07690
Panther DB PTHR23505 PTHR23505:SF10
NCBI CDD KOG1330; Sugar transporter/spinster transmembrane protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10190 : Major facilitator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g31700.1 : UNE2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001381 , Zm00025a053026
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G066490.1
Wheat TraesCS4B02G240000 , TraesCS4B02G240000 , TraesCS4A02G063000 , TraesCS5B02G193800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G019550 - -
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3 Sobic.010G035600 - -
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12 Sobic.004G337850 - -
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14 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
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16 Sobic.001G182900 - -
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19 Sobic.002G220400 - -
20 Sobic.003G172500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G450900--Sobic004G019550 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G450900--Sobic001G154000 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G450900--Sobic010G035600 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G450900--Sobic003G286450 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G450900--Sobic001G476800 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic001G450900--Sobic001G535850 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G450900--Sobic007G065000 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G450900--Sobic005G139750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G450900--Sobic008G171200 Sobic004G019550--Sobic001G154000 Sobic004G019550--Sobic010G035600 Sobic004G019550--Sobic003G286450 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic004G019550--Sobic002G220400 Sobic004G019550--Sobic001G476800 Sobic004G019550--Sobic001G535850 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic004G019550--Sobic003G344300 Sobic004G019550--Sobic005G139750 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic004G019550--Sobic006G135701 Sobic001G154000--Sobic004G019550 Sobic001G154000--Sobic001G535850 Sobic001G154000--Sobic003G286450 Sobic001G154000--Sobic010G035600 Sobic001G154000--Sobic002G220400 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic003G344300 Sobic001G154000--Sobic001G476800 Sobic001G154000--Sobic005G139750 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic010G035600--Sobic010G185250 SobicK029400 SobicK029400 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic001G476800--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G035600 Sobic001G476800--Sobic003G286450 Sobic001G476800--Sobic004G019550 Sobic001G476800--Sobic002G159750 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic001G182900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G476800--Sobic004G207800 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic007G065000--Sobic010G035600 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic007G065000--Sobic003G169000 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G065000--Sobic003G169100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic007G065000--Sobic003G369533 Sobic007G065000--SobicK029400 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic010G206600 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic007G065000--Sobic003G352000 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic007G065000--Sobic003G168200 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic008G171200--Sobic001G476800 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic008G171200--Sobic004G157050 Sobic008G171200--Sobic007G113566 Sobic008G171200--Sobic004G207800 Sobic008G171200--Sobic010G175550 Sobic008G171200--Sobic010G035600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G182900 Sobic008G171200--Sobic003G286450
Octagon: transcription factors


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