Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G098100.1
Synonym OXS3, ATOXS3
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YNS3
Pfam -
Panther DB PTHR33172 PTHR33172:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G56550 : oxidative stress 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g13370.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020129
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G094550 - -
2 Sobic.006G016950 - -
3 Sobic.004G077700 - -
4 Sobic.002G401533 - -
5 Sobic.008G039200 - -
6 Sobic.001G037033 - -
7 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
8 Sobic.001G202450 - -
9 Sobic.003G253100 - -
10 Sobic.009G101500 - -
11 Sobic.009G210250 - -
12 Sobic.005G045250 - -
13 Sobic.005G139750 - -
14 Sobic.003G161900 - -
15 Sobic.001G107550 - -
16 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.009G077000 - -
19 Sobic.002G274300 - -
20 Sobic.004G150300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G098100 Sobic004G098100 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic004G098100--Sobic001G094550 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic004G098100--Sobic006G016950 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic004G098100--Sobic004G077700 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic004G098100--Sobic002G401533 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic004G098100--Sobic008G039200 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic004G098100--Sobic001G037033 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic004G098100--Sobic006G107700 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G098100--Sobic001G202450 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic004G098100--Sobic003G253100 Sobic002G274300 Sobic002G274300 Sobic001G094550--Sobic002G274300 Sobic001G094550--Sobic001G037033 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic001G094550--Sobic001G523150 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic001G094550--Sobic009G101500 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic001G094550--Sobic006G162750 Sobic001G094550--Sobic004G077700 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G094550--Sobic001G358366 Sobic001G094550--Sobic008G039200 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G094550--Sobic004G207800 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic006G016950--Sobic002G358450 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic006G016950--Sobic001G502801 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic006G016950--Sobic007G108600 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic006G016950--Sobic007G183200 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic006G016950--Sobic001G352633 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic006G016950--Sobic006G205300 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic006G016950--Sobic001G182700 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic006G016950--Sobic009G143750 Sobic006G016950--Sobic002G401533 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic002G401533 Sobic002G401533--Sobic006G107700 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic002G401533--Sobic003G161900 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G401533--Sobic003G056200 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic002G401533--Sobic001G475950 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic002G401533--Sobic001G261444 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic002G401533--Sobic009G077000 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic002G401533--Sobic003G172966 SobicK032200 SobicK032200 Sobic002G401533--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic005G104900 Sobic008G039200--Sobic001G523150 Sobic008G039200--Sobic003G253100 Sobic008G039200--Sobic001G037033 Sobic008G039200--Sobic001G094550 Sobic008G039200--Sobic005G139750 Sobic008G039200--Sobic002G159750 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic008G039200--Sobic010G206600 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic008G039200--Sobic005G139900 Sobic008G039200--Sobic001G535850 Sobic001G037033--Sobic006G107700 Sobic001G037033--Sobic002G401533 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G037033--Sobic009G257000 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic001G037033--Sobic010G169950 Sobic001G037033--Sobic001G094550 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G037033--Sobic009G210250 Sobic001G037033--Sobic002G159750 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G037033--Sobic007G090433 Sobic001G037033--Sobic003G056200 Sobic006G107700--Sobic003G056200 Sobic006G107700--Sobic002G401533 Sobic006G107700--Sobic009G257000 Sobic006G107700--Sobic003G172966 Sobic006G107700--Sobic001G475950 Sobic006G107700--Sobic003G161900 Sobic006G107700--Sobic001G261444 Sobic006G107700--SobicK032200 Sobic006G107700--Sobic001G037033 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G202450--Sobic001G373850 Sobic001G202450--Sobic009G077000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G202450--Sobic005G045250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G202450--Sobic002G214000 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G202450--Sobic005G019250 Sobic001G202450--Sobic009G210250 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G202450--Sobic003G163000 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic001G202450--Sobic003G208200 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G202450--Sobic004G332200 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic003G253100--Sobic001G283800 Sobic003G253100--Sobic008G039200 Sobic003G253100--Sobic001G523150 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G108600 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic003G253100--Sobic003G313600 Sobic003G253100--Sobic006G162750 Sobic003G253100--Sobic001G094550 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic003G253100--Sobic006G128150
Octagon: transcription factors


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