Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G075700.1
Synonym
Functional annotation CHASE domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RHS4
Pfam PF00069
Panther DB PTHR27007 PTHR27007:SF16
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10530 : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g26940.1 : CHASE domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G140700 , TraesCS7A02G507600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
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16 Sobic.010G061400 expressed protein -
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20 Sobic.007G045750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G075700 Sobic005G075700 SobicK032500 SobicK032500 Sobic005G075700--SobicK032500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic005G075700--Sobic010G166850 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic005G075700--Sobic002G022500 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G075700--Sobic001G527550 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G075700--Sobic010G156300 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic005G075700--Sobic001G050650 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G075700--Sobic005G116800 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic005G075700--Sobic005G119400 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G075700--Sobic006G083050 SobicK032500--Sobic002G022500 SobicK032500--Sobic010G166850 SobicK032500--Sobic001G527550 Sobic002G018200 Sobic002G018200 SobicK032500--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 SobicK032500--Sobic004G334501 SobicK032500--Sobic001G050650 Sobic001G180950 Sobic001G180950 SobicK032500--Sobic001G180950 SobicK032500--Sobic010G156300 Sobic010G166201 Sobic010G166201 SobicK032500--Sobic010G166201 Sobic010G166850--Sobic002G022500 Sobic010G166850--Sobic010G156300 Sobic010G166850--SobicK032500 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic010G166850--Sobic007G179100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic001G050650 Sobic010G166850--Sobic001G180950 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic007G045750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G166850--Sobic009G025750 Sobic002G022500--SobicK032500 Sobic002G022500--Sobic010G166850 Sobic002G022500--Sobic009G258800 Sobic002G022500--Sobic010G156300 Sobic002G022500--Sobic001G050650 Sobic002G022500--Sobic001G527550 Sobic002G022500--Sobic001G180950 Sobic002G022500--Sobic010G166201 Sobic002G022500--Sobic002G018200 Sobic001G527550--SobicK032500 Sobic001G527550--Sobic004G334501 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic001G527550--Sobic007G079901 Sobic001G527550--Sobic001G050650 Sobic001G527550--Sobic002G018200 Sobic001G527550--Sobic002G022500 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G527550--Sobic002G094000 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic001G527550--Sobic005G024500 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G527550--Sobic002G073000 Sobic010G156300--Sobic007G179100 Sobic010G156300--Sobic010G166850 Sobic010G156300--Sobic006G083050 Sobic010G156300--Sobic002G022500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic010G156300--Sobic008G041500 Sobic010G156300--SobicK032500 Sobic010G156300--Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic009G025750 Sobic001G050650--Sobic007G045750 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic009G025750 Sobic001G050650--Sobic002G073000 Sobic001G050650--Sobic010G166201 Sobic001G050650--SobicK032500 Sobic001G050650--Sobic005G119400 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic001G050650--Sobic002G062400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic001G050650--Sobic004G223700 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic005G119400--Sobic001G050650 Sobic005G119400--Sobic007G045750 Sobic005G119400--Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic009G025750 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic005G119400--Sobic001G401750 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic005G119400--Sobic009G035000 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic002G062400 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic005G119400--Sobic010G124100 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800
Octagon: transcription factors


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