Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G341900.1
Synonym RXF26, Sb03g038590
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5XNX3
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF152
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G58430 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61200.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039743
Brachypodium KQK10393
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.007G149500 expressed protein -
4 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
5 Sobic.004G305733 - -
6 Sobic.001G100300 - -
7 Sobic.001G145550 - -
8 Sobic.009G213150 - -
9 Sobic.002G176700 receptor-like protein kinase 2, putative, expressed -
10 Sobic.003G085533 - -
11 Sobic.002G202350 - -
12 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G094000 expressed protein -
14 Sobic.002G046150 - -
15 Sobic.003G230800 - -
16 Sobic.006G165200 amino acid permease family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G163400 - -
18 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
19 Sobic.009G020600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G527550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G341900--Sobic005G187700 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic003G341900--Sobic009G173700 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic003G341900--Sobic007G149500 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G341900--Sobic003G072000 Sobic004G305733 Sobic004G305733 Sobic003G341900--Sobic004G305733 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic003G341900--Sobic001G100300 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic003G341900--Sobic001G145550 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G341900--Sobic009G213150 Sobic002G176700 Sobic002G176700 Sobic003G341900--Sobic002G176700 Sobic005G187700--Sobic003G072000 Sobic005G187700--Sobic009G173700 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic003G341900 Sobic005G187700--Sobic007G149500 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic002G202350 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G187700--Sobic001G527550 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic005G187700--Sobic001G014600 Sobic009G173700--Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic001G014600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic006G221500 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic009G173700--Sobic008G142500 Sobic009G173700--Sobic001G100300 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic009G173700--Sobic006G235801 Sobic009G173700--Sobic003G341900 Sobic009G173700--Sobic007G149500 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic009G173700--Sobic007G042700 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic007G149500--Sobic002G046150 Sobic007G149500--Sobic001G145550 Sobic007G149500--Sobic005G187700 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic007G149500--Sobic002G208700 Sobic007G149500--Sobic001G100300 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic007G149500--Sobic001G187900 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic007G149500--Sobic009G037500 Sobic007G149500--Sobic003G341900 Sobic007G149500--Sobic009G173700 Sobic003G072000--Sobic005G187700 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic003G072000--Sobic002G134800 Sobic003G072000--Sobic009G213150 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic003G072000--Sobic001G032850 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G072000--Sobic004G272950 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic003G072000--Sobic003G168600 SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G072000--SobicK043600 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic003G072000--Sobic002G126700 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic003G072000--Sobic001G401750 Sobic009G020600 Sobic009G020600 Sobic004G305733--Sobic009G020600 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic004G305733--Sobic002G163400 Sobic004G305733--Sobic003G072000 Sobic004G305733--Sobic001G032850 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic004G305733--Sobic009G030501 Sobic004G305733--Sobic005G187700 Sobic004G305733--Sobic003G341900 Sobic002G163500 Sobic002G163500 Sobic004G305733--Sobic002G163500 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic004G305733--Sobic003G301050 Sobic001G100300--Sobic009G173700 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic001G100300--Sobic010G100600 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic001G100300--Sobic009G235400 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic001G100300--Sobic010G235100 Sobic001G100300--Sobic007G149500 Sobic001G100300--Sobic006G235801 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic001G100300--Sobic006G045601 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic001G100300--Sobic005G118800 Sobic006G121950 Sobic006G121950 Sobic001G100300--Sobic006G121950 Sobic001G145550--Sobic009G037500 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic001G145550--Sobic001G422001 Sobic001G145550--Sobic009G213150 Sobic001G145550--Sobic007G149500 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G145550--Sobic006G094900 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G145550--Sobic002G094000 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic001G145550--Sobic004G278800 Sobic001G145550--Sobic003G142500 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic001G145550--Sobic002G375500 Sobic009G213150--Sobic002G094000 Sobic009G213150--Sobic006G094900 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic009G213150--Sobic007G179266 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic009G213150--Sobic002G073000 Sobic009G213150--Sobic003G142500 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic009G213150--Sobic003G368550 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic009G213150--Sobic008G129500 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic009G213150--Sobic002G121050 Sobic009G213150--Sobic003G072000 Sobic002G176700--Sobic002G375500 Sobic002G176700--Sobic003G341900 Sobic002G176700--Sobic001G145550 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic002G176700--Sobic008G165500 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic002G176700--Sobic005G168200 Sobic002G176700--Sobic002G163400 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic002G176700--Sobic007G174500 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic002G176700--Sobic006G145300 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic002G176700--Sobic004G072600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.