Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G400700.2
Synonym Sb02g041560
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W7R9
Pfam -
Panther DB PTHR34799
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57440 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048993 , Zm00025a015336
Brachypodium KQK14890
Barley -
Wheat TraesCS5D02G433900 , TraesCS2A02G134200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G031300 - -
2 Sobic.006G239200 expressed protein -
3 Sobic.003G059450 - -
4 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
5 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
6 Sobic.003G436100 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G334700 - -
8 Sobic.001G208133 - -
9 Sobic.009G188200 - -
10 Sobic.009G078401 - -
11 Sobic.006G037800 - -
12 Sobic.002G168700 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
13 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
14 Sobic.001G376332 - -
15 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
16 Sobic.009G078300 expressed protein -
17 Sobic.009G011050 - -
18 Sobic.002G142400 - -
19 Sobic.001G202800 - -
20 Sobic.002G325000 O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G400700 Sobic002G400700 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G400700--Sobic003G031300 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic002G400700--Sobic006G239200 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic002G400700--Sobic003G059450 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic002G400700--Sobic003G311300 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic002G400700--Sobic007G134700 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic002G400700--Sobic003G436100 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G400700--Sobic002G334700 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic002G400700--Sobic001G208133 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic002G400700--Sobic009G188200 Sobic003G031300--Sobic003G311300 Sobic003G031300--Sobic006G239200 Sobic003G031300--Sobic001G208133 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic003G031300--Sobic004G079400 Sobic003G031300--Sobic003G059450 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic003G031300--Sobic004G352750 Sobic003G031300--Sobic002G334700 Sobic003G031300--Sobic002G400700 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic003G031300--Sobic009G011050 Sobic006G239200--Sobic003G311300 Sobic006G239200--Sobic009G011050 Sobic006G239200--Sobic001G208133 Sobic006G239200--Sobic003G031300 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic006G239200--Sobic001G202800 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic006G239200--Sobic002G142400 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic007G134700 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic006G239200--Sobic006G038050 Sobic003G059450--Sobic009G188200 Sobic003G059450--Sobic003G436100 Sobic003G059450--Sobic003G031300 Sobic003G059450--Sobic002G334700 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic003G059450--Sobic010G033750 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic003G059450--Sobic009G078401 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic003G059450--Sobic004G278800 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic003G059450--Sobic002G094100 Sobic003G059450--Sobic006G239200 Sobic003G311300--Sobic001G208133 Sobic003G311300--Sobic006G239200 Sobic003G311300--Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic003G031300 Sobic003G311300--Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic009G011050 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic001G202800 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic003G311300--Sobic003G030100 Sobic007G134700--Sobic006G037800 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic007G134700--Sobic010G149000 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic007G134700--Sobic003G254850 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic007G134700--Sobic008G056000 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G134700--Sobic010G052100 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic001G202800 Sobic007G134700--Sobic009G011050 Sobic007G134700--Sobic006G239200 Sobic003G436100--Sobic009G188200 Sobic003G436100--Sobic003G059450 Sobic003G436100--Sobic002G334700 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic003G436100--Sobic009G097500 Sobic003G436100--Sobic002G094100 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic003G436100--Sobic007G179266 Sobic006G200650 Sobic006G200650 Sobic003G436100--Sobic006G200650 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic003G436100--Sobic005G176300 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic003G436100--Sobic003G205000 Sobic002G334700--Sobic003G205000 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic002G334700--Sobic002G199300 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic002G334700--Sobic009G215100 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic002G334700--Sobic006G053550 Sobic002G334700--Sobic003G436100 Sobic002G334700--Sobic003G059450 Sobic002G334700--Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic002G094100 Sobic002G334700--Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G208133--Sobic004G039000 Sobic009G188200--Sobic003G436100 Sobic009G188200--Sobic003G059450 Sobic009G188200--Sobic009G097500 Sobic009G188200--Sobic007G179266 Sobic009G188200--Sobic005G176300 Sobic009G188200--Sobic006G200650 Sobic009G188200--Sobic002G334700 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic009G188200--Sobic004G127350 Sobic009G188200--Sobic010G052100
Octagon: transcription factors


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