Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G108600.2
Synonym Sb04g008890
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RML2
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF130
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G40070 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g34620.1 : Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019969
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G146701 - -
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19 Sobic.005G019650 - -
20 Sobic.001G369101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G108600 Sobic004G108600 Sobic002G146701 Sobic002G146701 Sobic004G108600--Sobic002G146701 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic004G108600--Sobic005G217400 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic004G108600--Sobic004G007550 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic004G108600--Sobic004G300400 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic004G108600--Sobic007G118700 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic004G108600--Sobic010G041301 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic004G108600--Sobic010G230100 Sobic004G337132 Sobic004G337132 Sobic004G108600--Sobic004G337132 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic004G108600--Sobic007G151900 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic002G146701--Sobic006G024101 Sobic002G146701--Sobic004G300400 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic002G146701--Sobic006G185150 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic002G146701--Sobic003G294550 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic002G146701--Sobic005G019650 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic002G146701--Sobic008G135401 Sobic002G146701--Sobic004G337132 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic002G146701--Sobic010G180300 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic002G146701--Sobic010G263051 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic005G217400--Sobic001G310400 Sobic005G217400--Sobic007G118700 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic005G217400--Sobic003G193400 Sobic005G217400--Sobic004G300400 Sobic005G217400--Sobic006G185150 Sobic005G217400--Sobic003G294550 Sobic005G217400--Sobic006G024101 Sobic005G217400--Sobic004G108600 Sobic005G217400--Sobic005G019650 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic004G007550--Sobic006G244900 Sobic004G217400 Sobic004G217400 Sobic004G007550--Sobic004G217400 Sobic003G329100 Sobic003G329100 Sobic004G007550--Sobic003G329100 Sobic004G007550--Sobic007G151900 Sobic004G007550--Sobic004G337132 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic004G007550--Sobic001G018700 Sobic004G300400--Sobic007G151900 Sobic004G300400--Sobic003G294550 Sobic004G300400--Sobic004G337132 Sobic004G300400--Sobic006G185150 Sobic004G300400--Sobic004G007550 Sobic004G300400--Sobic004G217400 Sobic004G300400--Sobic006G024101 Sobic004G300400--Sobic002G146701 Sobic004G300400--Sobic006G244900 Sobic007G118700--Sobic005G217400 Sobic007G118700--Sobic004G007550 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic007G118700--Sobic010G216500 Sobic007G118700--Sobic004G337132 Sobic007G118700--Sobic004G300400 Sobic007G118700--Sobic001G310400 Sobic007G118700--Sobic006G244900 Sobic007G118700--Sobic004G217400 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic007G118700--Sobic001G120850 Sobic009G116832 Sobic009G116832 Sobic010G041301--Sobic009G116832 Sobic003G242400 Sobic003G242400 Sobic010G041301--Sobic003G242400 Sobic010G041301--Sobic003G329100 Sobic010G041301--Sobic004G007550 Sobic010G041301--Sobic004G300400 Sobic010G041301--Sobic007G151900 Sobic010G041301--Sobic010G230100 Sobic010G041301--Sobic006G244900 Sobic001G452800 Sobic001G452800 Sobic010G041301--Sobic001G452800 Sobic009G230300 Sobic009G230300 Sobic010G230100--Sobic009G230300 Sobic010G230100--Sobic003G329100 Sobic010G230100--Sobic004G007550 Sobic010G230100--Sobic006G244900 Sobic010G230100--Sobic009G116832 Sobic010G230100--Sobic001G018700 Sobic004G337132--Sobic004G300400 Sobic004G337132--Sobic004G007550 Sobic004G337132--Sobic006G244900 Sobic004G337132--Sobic004G217400 Sobic004G337132--Sobic007G151900 Sobic004G337132--Sobic003G329100 Sobic001G013701 Sobic001G013701 Sobic004G337132--Sobic001G013701 Sobic004G337132--Sobic002G146701 Sobic004G337132--Sobic003G294550 Sobic007G151900--Sobic004G300400 Sobic007G151900--Sobic004G007550 Sobic007G151900--Sobic006G244900 Sobic007G151900--Sobic004G217400 Sobic007G151900--Sobic004G337132 Sobic007G151900--Sobic003G329100 Sobic007G151900--Sobic003G294550 Sobic007G151900--Sobic010G041301 Sobic007G151900--Sobic002G146701
Octagon: transcription factors


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