Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G126100.2
Synonym
Functional annotation receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RMV6
Pfam PF13855 PF07714
Panther DB PTHR27000
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G08850 : Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g33110.1 : receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT71940
Barley -
Wheat TraesCS1D02G050400 , TraesCS1D02G051000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G118050 - -
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13 Sobic.007G028300 - -
14 Sobic.006G280400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@phosphatidylinositol-4-phosphate 5-Kinase, putative, expressed K00921: PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase
15 Sobic.004G157050 - -
16 Sobic.001G476800 - -
17 Sobic.004G303900 - -
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19 Sobic.010G175550 - -
20 Sobic.005G028500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G126100 Sobic004G126100 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic004G126100--Sobic001G118050 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic004G126100--Sobic007G113566 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic004G126100--Sobic006G135701 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic004G126100--Sobic001G201933 Sobic004G162100 Sobic004G162100 Sobic004G126100--Sobic004G162100 Sobic001G470700 Sobic001G470700 Sobic004G126100--Sobic001G470700 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic004G126100--Sobic006G263250 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic004G126100--Sobic010G002301 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic004G126100--Sobic006G100150 Sobic001G118050--Sobic006G135701 Sobic001G118050--Sobic007G113566 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G118050--Sobic002G220400 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic001G118050--Sobic004G252600 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G118050--Sobic001G476800 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G118050--Sobic004G019550 Sobic001G118050--Sobic006G100150 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic001G118050--Sobic010G175550 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G118050--Sobic001G154000 Sobic007G113566--Sobic001G118050 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic007G113566--Sobic008G171200 Sobic007G113566--Sobic006G135701 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic010G002301 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic007G113566--Sobic004G207800 Sobic007G113566--Sobic001G476800 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic007G113566--Sobic003G139600 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic007G113566--Sobic001G465600 Sobic006G135701--Sobic001G118050 Sobic006G135701--Sobic007G113566 Sobic006G135701--Sobic002G220400 Sobic006G135701--Sobic004G019550 Sobic006G135701--Sobic001G476800 Sobic006G135701--Sobic001G154000 Sobic006G135701--Sobic004G252600 Sobic006G135701--Sobic010G175550 Sobic006G135701--Sobic008G171200 Sobic001G201933--Sobic010G002301 Sobic001G201933--Sobic003G139600 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic007G113566 Sobic001G201933--Sobic001G465600 Sobic001G201933--Sobic004G162100 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic001G201933--Sobic004G078200 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic001G201933--Sobic006G219400 Sobic001G201933--Sobic004G157050 Sobic004G162100--Sobic001G201933 Sobic004G162100--Sobic003G139600 Sobic004G162100--Sobic010G002301 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic004G162100--Sobic004G282966 Sobic004G162100--Sobic002G191900 Sobic004G162100--Sobic001G465600 Sobic004G162100--Sobic007G113566 Sobic004G162100--Sobic004G157050 Sobic004G162100--Sobic004G126100 Sobic001G470700--Sobic006G263250 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic001G470700--Sobic001G205950 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic001G470700--Sobic003G238750 Sobic001G470700--Sobic004G126100 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic001G470700--Sobic001G136850 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic001G470700--Sobic006G059150 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic001G470700--Sobic010G053700 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic001G470700--Sobic003G069400 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G470700--Sobic006G048400 Sobic006G263250--Sobic001G136850 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic006G263250--Sobic006G146700 Sobic006G263250--Sobic006G059150 Sobic006G263250--Sobic001G118050 Sobic006G263250--Sobic006G100150 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic006G263250--Sobic001G039750 Sobic006G263250--Sobic001G470700 Sobic006G263250--Sobic004G252600 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic006G263250--Sobic009G260550 Sobic010G002301--Sobic003G139600 Sobic010G002301--Sobic001G465600 Sobic010G002301--Sobic001G201933 Sobic010G002301--Sobic004G157050 Sobic010G002301--Sobic007G113566 Sobic010G002301--Sobic002G191900 Sobic010G002301--Sobic008G171200 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic010G002301--Sobic001G331650 Sobic010G002301--Sobic004G207800 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic006G100150--Sobic004G303900 Sobic006G100150--Sobic004G078200 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic006G100150--Sobic007G028300 Sobic006G100150--Sobic009G260550 Sobic006G100150--Sobic004G252600 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic006G100150--Sobic003G169700 Sobic006G100150--Sobic001G118050 Sobic006G100150--Sobic004G207800 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic006G100150--Sobic006G206600
Octagon: transcription factors


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