Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G324900.1
Synonym Sb04g035470
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5XUB3
Pfam PF02151 PF13474
Panther DB PTHR34957 PTHR34957:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G09250 : Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g54710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022411
Brachypodium KQK01074
Barley -
Wheat TraesCS6B02G381700 , TraesCS6B02G381700 , TraesCS6B02G381700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.005G037500 expressed protein -
3 Sobic.006G209100 - -
4 Sobic.004G351866 - -
5 Sobic.001G361500 expressed protein -
6 Sobic.006G185400 - -
7 Sobic.004G330500 expressed protein -
8 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.008G023500 expressed protein -
10 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
11 Sobic.002G205201 - -
12 Sobic.001G019100 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
14 Sobic.001G172900 - -
15 Sobic.006G201200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
16 Sobic.010G275550 - -
17 Sobic.010G231400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G090201 - -
20 Sobic.009G010800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G324900 Sobic004G324900 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic004G324900--Sobic002G037000 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic004G324900--Sobic005G037500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic004G324900--Sobic006G209100 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic004G324900--Sobic004G351866 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic004G324900--Sobic001G361500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic004G324900--Sobic006G185400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic004G324900--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic004G324900--Sobic005G189400 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic004G324900--Sobic008G023500 Sobic002G037000--Sobic005G037500 Sobic002G037000--Sobic006G185400 Sobic002G037000--Sobic004G330500 Sobic002G037000--Sobic005G189400 Sobic002G037000--Sobic008G023500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic002G037000--Sobic002G205201 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic002G037000--Sobic010G275550 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic002G037000--Sobic007G152200 Sobic002G037000--Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic002G037000 Sobic005G037500--Sobic006G185400 Sobic005G037500--Sobic004G330500 Sobic005G037500--Sobic005G189400 Sobic005G037500--Sobic002G205201 Sobic005G037500--Sobic007G152200 Sobic005G037500--Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic008G023500 Sobic006G209100--Sobic006G185400 Sobic006G209100--Sobic004G330500 Sobic006G209100--Sobic005G189400 Sobic006G209100--Sobic001G361500 Sobic006G209100--Sobic002G205201 Sobic006G209100--Sobic007G152200 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic006G209100--Sobic009G164200 Sobic006G209100--Sobic008G023500 Sobic006G209100--Sobic005G037500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic008G023500 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic004G351866--Sobic003G357000 Sobic004G351866--Sobic004G330500 Sobic004G351866--Sobic005G189400 Sobic004G351866--Sobic006G185400 Sobic004G351866--Sobic002G037000 Sobic004G351866--Sobic005G037500 Sobic004G351866--Sobic007G152200 Sobic001G361500--Sobic006G185400 Sobic001G361500--Sobic004G330500 Sobic001G361500--Sobic005G189400 Sobic001G361500--Sobic006G209100 Sobic001G361500--Sobic002G205201 Sobic001G361500--Sobic007G152200 Sobic001G361500--Sobic009G164200 Sobic001G361500--Sobic008G023500 Sobic001G361500--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic009G164200 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic005G189400--Sobic004G330500 Sobic005G189400--Sobic006G185400 Sobic005G189400--Sobic007G152200 Sobic005G189400--Sobic002G205201 Sobic005G189400--Sobic001G361500 Sobic005G189400--Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic008G023500 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic006G090201 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500
Octagon: transcription factors


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