Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G143800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PSG7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g17560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
2 Sobic.003G254400 expressed protein -
3 Sobic.005G080075 - -
4 Sobic.001G100650 - -
5 Sobic.010G064050 - -
6 Sobic.003G318600 - -
7 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin
8 Sobic.002G082350 - -
9 Sobic.009G073200 expressed protein -
10 Sobic.002G313850 - -
11 Sobic.003G267400 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
12 Sobic.001G413400 matrix attachment region binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G057500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.001G101650 - -
15 Sobic.008G191800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G050700 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
17 Sobic.010G263151 - -
18 Sobic.010G123000 - -
19 Sobic.009G190100 expressed protein -
20 Sobic.001G209000 secretory protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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