Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G050700.1
Synonym ARR12, Sb05g004150, RR12
Functional annotation two-component response regulator, putative, expressed
UniProt C5Y5J4
Pfam PF00072
Panther DB PTHR26402 PTHR26402:SF529
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14491; two-component response regulator ARR-B family
Gene Ontology GO:0000160; phosphorelay signal transduction system


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G25180 : response regulator 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g08500.1 : two-component response regulator, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042121 , Zm00025a051552
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G143800 expressed protein -
2 Sobic.007G121800 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
3 Sobic.002G082350 - -
4 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
5 Sobic.010G064050 - -
6 Sobic.001G100650 - -
7 Sobic.009G197350 - -
8 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G080075 - -
10 Sobic.003G254400 expressed protein -
11 Sobic.009G073200 expressed protein -
12 Sobic.002G124766 - -
13 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
15 Sobic.002G269800 - -
16 Sobic.007G003300 - -
17 Sobic.002G313850 - -
18 Sobic.008G191800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G413400 matrix attachment region binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G050700 Sobic005G050700 Sobic005G143800 Sobic005G143800 Sobic005G050700--Sobic005G143800 Sobic007G121800 Sobic007G121800 Sobic005G050700--Sobic007G121800 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic005G050700--Sobic002G082350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic005G050700--Sobic007G145300 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic005G050700--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic005G050700--Sobic001G100650 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic005G050700--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic005G050700--Sobic009G156700 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic005G050700--Sobic005G080075 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic005G143800--Sobic003G008400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic005G143800--Sobic003G254400 Sobic005G143800--Sobic005G080075 Sobic005G143800--Sobic001G100650 Sobic005G143800--Sobic010G064050 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic005G143800--Sobic003G318600 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic005G143800--Sobic003G360500 Sobic005G143800--Sobic002G082350 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic005G143800--Sobic009G073200 Sobic007G121800--Sobic005G080075 Sobic007G121800--Sobic003G254400 Sobic007G121800--Sobic001G100650 Sobic007G121800--Sobic010G064050 Sobic007G121800--Sobic003G008400 Sobic007G121800--Sobic002G082350 Sobic007G121800--Sobic009G073200 Sobic007G121800--Sobic003G318600 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic007G121800--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic002G082350--Sobic007G145300 Sobic007G145300--Sobic009G197350 Sobic007G145300--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic007G145300--Sobic002G269800 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic007G145300--Sobic002G124766 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic007G145300--Sobic003G126700 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic007G145300--Sobic007G003300 Sobic007G145300--Sobic002G082350 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic007G145300--Sobic006G223700 Sobic007G145300--Sobic010G064050 Sobic010G064050--Sobic001G100650 Sobic010G064050--Sobic005G080075 Sobic010G064050--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic003G008400 Sobic010G064050--Sobic003G254400 Sobic010G064050--Sobic009G073200 Sobic010G064050--Sobic003G318600 Sobic010G064050--Sobic003G360500 Sobic010G064050--Sobic002G313850 Sobic001G100650--Sobic001G100650 Sobic001G100650--Sobic005G080075 Sobic001G100650--Sobic002G082350 Sobic001G100650--Sobic003G008400 Sobic001G100650--Sobic003G254400 Sobic001G100650--Sobic009G073200 Sobic001G100650--Sobic003G318600 Sobic001G100650--Sobic003G360500 Sobic001G100650--Sobic002G313850 Sobic009G197350--Sobic009G156700 Sobic009G197350--Sobic007G145300 Sobic009G197350--Sobic002G269800 Sobic009G197350--Sobic003G126700 Sobic009G197350--Sobic002G124766 Sobic009G197350--Sobic007G003300 Sobic009G197350--Sobic006G223700 Sobic009G197350--Sobic002G082350 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic009G197350--Sobic007G193000 Sobic009G156700--Sobic009G156700 Sobic009G156700--Sobic007G145300 Sobic009G156700--Sobic002G269800 Sobic009G156700--Sobic003G126700 Sobic009G156700--Sobic002G124766 Sobic009G156700--Sobic007G003300 Sobic009G156700--Sobic006G223700 Sobic009G156700--Sobic002G082350 Sobic009G156700--Sobic007G193000 Sobic005G080075--Sobic001G100650 Sobic005G080075--Sobic010G064050 Sobic005G080075--Sobic003G008400 Sobic005G080075--Sobic002G082350 Sobic005G080075--Sobic003G254400 Sobic005G080075--Sobic009G073200 Sobic005G080075--Sobic003G318600 Sobic005G080075--Sobic003G360500 Sobic001G413400 Sobic001G413400 Sobic005G080075--Sobic001G413400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.