Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G227800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PU79
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G029600 histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
2 Sobic.005G147200 - -
3 Sobic.004G076600 zinc-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G147032 - -
5 Sobic.005G221100 - -
6 Sobic.005G145900 - -
7 Sobic.008G045650 - -
8 Sobic.008G126300 - -
9 Sobic.005G223000 DEFL14 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
10 Sobic.005G147100 - -
11 Sobic.010G191500 - -
12 Sobic.009G039200 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
13 Sobic.005G150100 - -
14 Sobic.010G010500 - -
15 Sobic.004G076400 zinc-binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G098300 OsIAA29 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
17 Sobic.008G050300 expressed protein -
18 Sobic.008G120200 - -
19 Sobic.005G141700 - -
20 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase


Gene co-expression network
sample Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic005G227800--Sobic010G029600 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G227800--Sobic005G147200 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic005G227800--Sobic004G076600 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic005G227800--Sobic005G147032 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic005G227800--Sobic005G221100 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic005G227800--Sobic005G145900 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic005G227800--Sobic008G045650 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic005G227800--Sobic008G126300 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic005G227800--Sobic005G223000 Sobic010G029600--Sobic005G227800 Sobic010G029600--Sobic005G147200 Sobic010G029600--Sobic005G221100 Sobic010G029600--Sobic005G147032 Sobic010G029600--Sobic005G223000 Sobic010G029600--Sobic005G145900 Sobic010G029600--Sobic008G045650 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic010G029600--Sobic005G147100 Sobic010G029600--Sobic004G076600 Sobic005G147200--Sobic010G029600 Sobic005G147200--Sobic005G147032 Sobic005G147200--Sobic005G227800 Sobic005G147200--Sobic005G221100 Sobic005G147200--Sobic005G147100 Sobic005G147200--Sobic005G223000 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic005G147200--Sobic010G010500 Sobic005G147200--Sobic005G145900 Sobic005G147200--Sobic008G045650 Sobic004G076600--Sobic008G126300 Sobic004G076600--Sobic005G227800 Sobic004G076600--Sobic010G029600 Sobic004G076600--Sobic008G045650 Sobic004G076600--Sobic005G145900 Sobic004G076600--Sobic005G221100 Sobic004G076600--Sobic005G147200 Sobic004G076600--Sobic005G147032 Sobic004G076600--Sobic005G223000 Sobic005G147032--Sobic005G147200 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic005G147032--Sobic005G150100 Sobic005G147032--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G227800 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic010G010500 Sobic005G147032--Sobic005G147100 Sobic005G147032--Sobic005G221100 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic005G147032--Sobic005G098300 Sobic005G221100--Sobic005G223000 Sobic005G221100--Sobic008G045650 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic005G221100--Sobic010G191500 Sobic005G221100--Sobic010G029600 Sobic005G221100--Sobic005G145900 Sobic005G221100--Sobic005G147200 Sobic005G221100--Sobic005G147100 Sobic005G221100--Sobic005G227800 Sobic005G221100--Sobic010G010500 Sobic005G145900--Sobic005G221100 Sobic005G145900--Sobic008G045650 Sobic005G145900--Sobic005G223000 Sobic005G145900--Sobic010G191500 Sobic005G145900--Sobic010G029600 Sobic005G145900--Sobic005G147200 Sobic005G145900--Sobic005G227800 Sobic005G145900--Sobic005G147100 Sobic005G145900--Sobic005G147032 Sobic008G045650--Sobic005G221100 Sobic008G045650--Sobic010G191500 Sobic008G045650--Sobic005G223000 Sobic008G045650--Sobic005G145900 Sobic008G045650--Sobic010G029600 Sobic008G045650--Sobic005G227800 Sobic008G045650--Sobic005G147200 Sobic008G045650--Sobic005G147100 Sobic008G045650--Sobic004G076600 Sobic008G126300--Sobic004G076600 Sobic008G126300--Sobic005G227800 Sobic008G126300--Sobic010G029600 Sobic008G126300--Sobic005G147200 Sobic008G126300--Sobic005G147032 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic008G126300--Sobic007G040600 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic008G126300--Sobic002G250800 Sobic008G126300--Sobic005G221100 Sobic008G126300--Sobic005G145900 Sobic005G223000--Sobic005G221100 Sobic005G223000--Sobic010G191500 Sobic005G223000--Sobic008G045650 Sobic005G223000--Sobic005G147100 Sobic005G223000--Sobic005G145900 Sobic005G223000--Sobic010G029600 Sobic005G223000--Sobic005G147200 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic005G223000--Sobic008G120200 Sobic005G223000--Sobic010G010500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.