Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G050300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R4T9
Pfam -
Panther DB PTHR32133
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g17710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.005G150100 - -
3 Sobic.005G147032 - -
4 Sobic.007G040600 - -
5 Sobic.004G076400 zinc-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G147200 - -
7 Sobic.005G227800 - -
8 Sobic.010G029600 histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
9 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G250800 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
11 Sobic.008G126300 - -
12 Sobic.005G098300 OsIAA29 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
13 Sobic.004G221700 expressed protein -
14 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
15 Sobic.010G010500 - -
16 Sobic.005G147100 - -
17 Sobic.005G221100 - -
18 Sobic.004G076600 zinc-binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G039200 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.004G048400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic008G050300--Sobic005G212000 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic008G050300--Sobic005G150100 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic008G050300--Sobic005G147032 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic008G050300--Sobic007G040600 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic008G050300--Sobic004G076400 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic008G050300--Sobic005G147200 Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic008G050300--Sobic005G227800 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic008G050300--Sobic010G029600 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic008G050300--Sobic005G133100 Sobic005G212000--Sobic008G050300 Sobic005G212000--Sobic005G150100 Sobic005G212000--Sobic004G076400 Sobic005G212000--Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic007G040600 Sobic005G212000--Sobic005G133100 Sobic005G212000--Sobic005G147200 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G212000--Sobic002G250800 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G212000--Sobic004G221700 Sobic005G150100--Sobic004G076400 Sobic005G150100--Sobic005G147032 Sobic005G150100--Sobic008G050300 Sobic005G150100--Sobic005G212000 Sobic005G150100--Sobic005G147200 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic005G150100--Sobic005G098300 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic005G150100--Sobic010G010500 Sobic005G150100--Sobic004G221700 Sobic005G150100--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G147200 Sobic005G147032--Sobic005G150100 Sobic005G147032--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G227800 Sobic005G147032--Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic010G010500 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic005G147032--Sobic005G147100 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic005G147032--Sobic005G221100 Sobic005G147032--Sobic005G098300 Sobic007G040600--Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic002G250800 Sobic007G040600--Sobic005G212000 Sobic007G040600--Sobic005G133100 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic007G040600--Sobic008G126300 Sobic007G040600--Sobic005G150100 Sobic007G040600--Sobic005G147032 Sobic007G040600--Sobic005G227800 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic007G040600--Sobic005G221300 Sobic004G076400--Sobic005G150100 Sobic004G076400--Sobic005G098300 Sobic004G076400--Sobic004G221700 Sobic004G076400--Sobic010G010500 Sobic004G076400--Sobic005G147032 Sobic002G151700 Sobic002G151700 Sobic004G076400--Sobic002G151700 Sobic004G076400--Sobic005G147200 Sobic004G076400--Sobic005G147100 Sobic004G076400--Sobic008G050300 Sobic005G147200--Sobic010G029600 Sobic005G147200--Sobic005G147032 Sobic005G147200--Sobic005G227800 Sobic005G147200--Sobic005G221100 Sobic005G147200--Sobic005G147100 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic005G147200--Sobic005G223000 Sobic005G147200--Sobic010G010500 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic005G147200--Sobic005G145900 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic005G147200--Sobic008G045650 Sobic005G227800--Sobic010G029600 Sobic005G227800--Sobic005G147200 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic005G227800--Sobic004G076600 Sobic005G227800--Sobic005G147032 Sobic005G227800--Sobic005G221100 Sobic005G227800--Sobic005G145900 Sobic005G227800--Sobic008G045650 Sobic005G227800--Sobic008G126300 Sobic005G227800--Sobic005G223000 Sobic010G029600--Sobic005G227800 Sobic010G029600--Sobic005G147200 Sobic010G029600--Sobic005G221100 Sobic010G029600--Sobic005G147032 Sobic010G029600--Sobic005G223000 Sobic010G029600--Sobic005G145900 Sobic010G029600--Sobic008G045650 Sobic010G029600--Sobic005G147100 Sobic010G029600--Sobic004G076600 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G133100--Sobic009G039000
Octagon: transcription factors


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