Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G221700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YS66
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g41830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021085
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G221700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G076400 zinc-binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G098300 OsIAA29 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
3 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
4 Sobic.010G010500 - -
5 Sobic.005G027100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.005G081800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.002G352501 - -
8 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
10 Sobic.006G007001 - -
11 Sobic.005G150100 - -
12 Sobic.002G352401 - -
13 Sobic.010G129300 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.006G006100 expressed protein -
15 Sobic.002G095000 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
16 Sobic.004G090400 - -
17 Sobic.005G147100 - -
18 Sobic.005G027200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.004G029500 - -
20 Sobic.004G316400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic004G221700--Sobic004G076400 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic004G221700--Sobic005G098300 Sobic002G151700 Sobic002G151700 Sobic004G221700--Sobic002G151700 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic004G221700--Sobic010G010500 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic004G221700--Sobic005G027100 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic004G221700--Sobic005G081800 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic004G221700--Sobic002G352501 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic004G221700--Sobic005G064400 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic004G221700--Sobic005G179700 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic004G076400--Sobic005G150100 Sobic004G076400--Sobic005G098300 Sobic004G076400--Sobic004G221700 Sobic004G076400--Sobic010G010500 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic004G076400--Sobic005G147032 Sobic004G076400--Sobic002G151700 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic004G076400--Sobic005G147200 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic004G076400--Sobic005G147100 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic004G076400--Sobic008G050300 Sobic005G098300--Sobic010G010500 Sobic005G098300--Sobic005G147100 Sobic005G098300--Sobic004G076400 Sobic005G098300--Sobic004G221700 Sobic005G098300--Sobic002G151700 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic005G098300--Sobic008G120200 Sobic005G098300--Sobic005G147200 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic005G098300--Sobic008G188300 Sobic005G098300--Sobic005G147032 Sobic002G151700--Sobic004G076400 Sobic002G151700--Sobic005G098300 Sobic002G151700--Sobic004G221700 Sobic002G151700--Sobic010G010500 Sobic002G151700--Sobic005G147100 Sobic002G151700--Sobic005G150100 Sobic002G151700--Sobic005G081800 Sobic002G151700--Sobic005G147032 Sobic002G151700--Sobic005G027100 Sobic010G010500--Sobic005G147100 Sobic010G010500--Sobic005G098300 Sobic010G010500--Sobic004G076400 Sobic010G010500--Sobic008G120200 Sobic010G010500--Sobic005G147200 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic010G010500--Sobic005G223000 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic010G010500--Sobic005G221100 Sobic010G010500--Sobic005G147032 Sobic010G010500--Sobic002G151700 Sobic005G027100--Sobic002G352501 Sobic005G027100--Sobic004G221700 Sobic005G027100--Sobic005G179700 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic005G027100--Sobic006G194900 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic005G027100--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic005G027100--Sobic004G090400 Sobic005G027100--Sobic005G098300 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic005G027100--Sobic004G316400 Sobic005G027100--Sobic005G064400 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic005G081800--Sobic002G095000 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic005G081800--Sobic010G129300 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic005G081800--Sobic004G029500 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic005G081800--Sobic006G007001 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G081800--Sobic002G058100 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic005G027200 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic010G191400 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic005G081800--Sobic006G006100 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic005G081800--Sobic006G006000 Sobic002G352501--Sobic005G179700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic002G352501--Sobic005G200400 Sobic002G352501--Sobic005G027100 Sobic002G352501--Sobic005G064400 Sobic002G352501--Sobic006G194900 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic002G352501--Sobic006G144101 Sobic002G352501--Sobic002G345500 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic004G090400 Sobic005G064400--Sobic006G007001 Sobic005G064400--Sobic010G129300 Sobic005G064400--Sobic006G006100 Sobic005G064400--Sobic005G081800 Sobic005G064400--Sobic002G352401 Sobic005G064400--Sobic004G029500 Sobic005G064400--Sobic002G095000 Sobic005G064400--Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic002G058100 Sobic005G179700--Sobic002G352501 Sobic005G179700--Sobic005G064400 Sobic005G179700--Sobic005G200400 Sobic005G179700--Sobic006G007001 Sobic005G179700--Sobic002G352401 Sobic005G179700--Sobic006G144101 Sobic005G179700--Sobic010G129300 Sobic005G179700--Sobic005G081800 Sobic005G179700--Sobic006G006100
Octagon: transcription factors


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