Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G090400.1,Sobic.004G090400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPN5 , A0A1Z5RLK5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.006G144101 - -
3 Sobic.005G200400 - -
4 Sobic.002G162100 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.005G153300 - -
6 Sobic.002G352501 - -
7 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
8 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
9 Sobic.008G071200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
10 Sobic.002G162200 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
11 Sobic.005G027100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.004G221700 expressed protein -
13 Sobic.004G015100 - -
14 Sobic.008G182200 - -
15 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.005G074600 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.002G352401 - -
19 Sobic.004G076400 zinc-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase


Gene co-expression network
sample Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic004G090400--Sobic002G345500 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic004G090400--Sobic006G144101 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic004G090400--Sobic005G200400 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic004G090400--Sobic002G162100 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic004G090400--Sobic005G153300 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic004G090400--Sobic002G352501 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic004G090400--Sobic005G179700 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic004G090400--Sobic003G411100 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic004G090400--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic006G144101 Sobic002G345500--Sobic004G090400 Sobic002G345500--Sobic005G200400 Sobic002G345500--Sobic002G162100 Sobic002G345500--Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic002G352501 Sobic002G345500--Sobic003G411100 Sobic002G345500--Sobic008G071200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic002G345500--Sobic002G162200 Sobic006G144101--Sobic002G345500 Sobic006G144101--Sobic005G200400 Sobic006G144101--Sobic002G162100 Sobic006G144101--Sobic004G090400 Sobic006G144101--Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic002G352501 Sobic006G144101--Sobic005G179700 Sobic006G144101--Sobic008G071200 Sobic005G200400--Sobic002G162100 Sobic005G200400--Sobic006G144101 Sobic005G200400--Sobic005G179700 Sobic005G200400--Sobic002G345500 Sobic005G200400--Sobic004G090400 Sobic005G200400--Sobic002G352501 Sobic005G200400--Sobic005G153300 Sobic005G200400--Sobic008G071200 Sobic005G200400--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic005G153300 Sobic002G162100--Sobic005G200400 Sobic002G162100--Sobic008G071200 Sobic002G162100--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic006G144101 Sobic002G162100--Sobic002G345500 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G090400 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic002G162100--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic008G071200 Sobic005G153300--Sobic002G162200 Sobic005G153300--Sobic002G162100 Sobic005G153300--Sobic004G015100 Sobic005G153300--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic005G200400 Sobic005G153300--Sobic006G144101 Sobic005G153300--Sobic002G345500 Sobic005G153300--Sobic004G090400 Sobic002G352501--Sobic005G179700 Sobic002G352501--Sobic005G200400 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic002G352501--Sobic005G027100 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic002G352501--Sobic005G064400 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic002G352501--Sobic006G194900 Sobic002G352501--Sobic006G144101 Sobic002G352501--Sobic002G345500 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic004G090400 Sobic005G179700--Sobic002G352501 Sobic005G179700--Sobic005G064400 Sobic005G179700--Sobic005G200400 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic005G179700--Sobic006G007001 Sobic005G179700--Sobic002G352401 Sobic005G179700--Sobic006G144101 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic005G179700--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic005G179700--Sobic005G081800 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic005G179700--Sobic006G006100 Sobic003G411100--Sobic006G144101 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic002G345500 Sobic003G411100--Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic005G200400 Sobic003G411100--Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic005G179700 Sobic003G411100--Sobic002G162100 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic003G411100--Sobic004G014700 Sobic008G071200--Sobic002G162200 Sobic008G071200--Sobic005G153300 Sobic008G071200--Sobic008G182200 Sobic008G071200--Sobic004G015100 Sobic008G071200--Sobic002G162100 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic005G200400 Sobic008G071200--Sobic006G144101 Sobic008G071200--Sobic002G345500
Octagon: transcription factors


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