Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G071200.1
Synonym ARR12, Sb08g006300, RR12
Functional annotation two-component response regulator, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R6B6
Pfam PF00072
Panther DB PTHR26402 PTHR26402:SF529
NCBI CDD KOG1601; GATA-4/5/6 transcription factors
KEGG Orthology K14491; two-component response regulator ARR-B family
Gene Ontology GO:0000160; phosphorelay signal transduction system


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G25180 : response regulator 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g08500.1 : two-component response regulator, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051552
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7A02G539700 , TraesCS7B02G461400 , TraesCS7B02G461400 , TraesCS7D02G525900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G162200 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.005G153300 - -
3 Sobic.008G182200 - -
4 Sobic.004G015100 - -
5 Sobic.002G162100 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.003G245500 OsFBDUF5 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G200400 - -
8 Sobic.006G144101 - -
9 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
10 Sobic.004G090400 - -
11 Sobic.005G074600 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.008G073800 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
13 Sobic.002G053201 - -
14 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.007G024100 - -
16 Sobic.001G324600 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.009G078600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.002G094900 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
19 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
20 Sobic.002G352501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic008G071200--Sobic002G162200 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic008G071200--Sobic005G153300 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic008G071200--Sobic008G182200 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic008G071200--Sobic004G015100 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic008G071200--Sobic002G162100 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic003G245500 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic008G071200--Sobic005G200400 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic008G071200--Sobic006G144101 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic008G071200--Sobic002G345500 Sobic002G162200--Sobic008G071200 Sobic002G162200--Sobic005G153300 Sobic002G162200--Sobic008G182200 Sobic002G162200--Sobic004G015100 Sobic002G162200--Sobic002G162100 Sobic002G162200--Sobic003G245500 Sobic002G162200--Sobic005G200400 Sobic002G162200--Sobic006G144101 Sobic002G162200--Sobic002G345500 Sobic005G153300--Sobic008G071200 Sobic005G153300--Sobic002G162200 Sobic005G153300--Sobic002G162100 Sobic005G153300--Sobic004G015100 Sobic005G153300--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic005G200400 Sobic005G153300--Sobic006G144101 Sobic005G153300--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic005G153300--Sobic004G090400 Sobic008G182200--Sobic002G162200 Sobic008G182200--Sobic008G071200 Sobic008G182200--Sobic004G015100 Sobic008G182200--Sobic003G245500 Sobic008G182200--Sobic005G153300 Sobic008G182200--Sobic002G162100 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G182200--Sobic002G053201 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic008G182200--Sobic008G073800 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic008G182200--Sobic007G024100 Sobic004G015100--Sobic008G071200 Sobic004G015100--Sobic002G162200 Sobic004G015100--Sobic005G153300 Sobic004G015100--Sobic008G182200 Sobic004G015100--Sobic002G162100 Sobic004G015100--Sobic003G245500 Sobic004G015100--Sobic005G200400 Sobic004G015100--Sobic006G144101 Sobic004G015100--Sobic002G345500 Sobic002G162100--Sobic005G153300 Sobic002G162100--Sobic005G200400 Sobic002G162100--Sobic008G071200 Sobic002G162100--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic006G144101 Sobic002G162100--Sobic002G345500 Sobic002G162100--Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G090400 Sobic002G162100--Sobic008G182200 Sobic003G245500--Sobic008G182200 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic003G245500--Sobic009G078600 Sobic003G245500--Sobic002G053201 Sobic003G245500--Sobic002G162200 Sobic003G245500--Sobic008G071200 Sobic003G245500--Sobic007G024100 Sobic003G245500--Sobic004G015100 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic003G245500--Sobic002G094900 Sobic003G245500--Sobic008G073800 Sobic005G200400--Sobic002G162100 Sobic005G200400--Sobic006G144101 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic005G200400--Sobic005G179700 Sobic005G200400--Sobic002G345500 Sobic005G200400--Sobic004G090400 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic005G200400--Sobic002G352501 Sobic005G200400--Sobic005G153300 Sobic005G200400--Sobic008G071200 Sobic005G200400--Sobic002G162200 Sobic006G144101--Sobic002G345500 Sobic006G144101--Sobic005G200400 Sobic006G144101--Sobic002G162100 Sobic006G144101--Sobic004G090400 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic002G352501 Sobic006G144101--Sobic005G179700 Sobic006G144101--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic006G144101 Sobic002G345500--Sobic004G090400 Sobic002G345500--Sobic005G200400 Sobic002G345500--Sobic002G162100 Sobic002G345500--Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic002G352501 Sobic002G345500--Sobic003G411100 Sobic002G345500--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic002G162200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.