Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G073800.1
Synonym Sb08g006590, scpl20
Functional annotation OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed
UniProt A0A1B6PBX0
Pfam PF00450
Panther DB PTHR11802 PTHR11802:SF62
NCBI CDD KOG1282; Serine carboxypeptidases (lysosomal cathepsin A)
KEGG Orthology K16296; serine carboxypeptidase-like clade I
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004185serine-type carboxypeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12910 : serine carboxypeptidase-like 20
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g15470.2 : OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025628 , Zm00025a054458
Brachypodium KQJ91721 , KQJ91720
Barley -
Wheat TraesCS3D02G438800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G053201 - -
2 Sobic.002G094900 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
3 Sobic.008G182200 - -
4 Sobic.003G245500 OsFBDUF5 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G162200 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.008G071200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
7 Sobic.004G015100 - -
8 Sobic.005G153300 - -
9 Sobic.007G024100 - -
10 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
11 Sobic.009G078600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.005G074600 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.002G162100 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.004G090400 - -
16 Sobic.003G207800 OsFBD2 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.006G144101 - -
18 Sobic.005G200400 - -
19 Sobic.008G071550 - -
20 Sobic.005G213900 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G073800--Sobic002G053201 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic008G073800--Sobic002G094900 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic008G073800--Sobic008G182200 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G073800--Sobic003G245500 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic008G073800--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic008G073800--Sobic008G071200 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic008G073800--Sobic004G015100 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic008G073800--Sobic005G153300 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic008G073800--Sobic007G024100 Sobic002G053201--Sobic002G094900 Sobic002G053201--Sobic003G245500 Sobic002G053201--Sobic008G073800 Sobic002G053201--Sobic007G024100 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic002G053201--Sobic009G078600 Sobic002G053201--Sobic008G182200 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic002G053201--Sobic003G207800 Sobic002G053201--Sobic002G162200 Sobic002G053201--Sobic008G071200 Sobic002G094900--Sobic002G053201 Sobic002G094900--Sobic003G207800 Sobic002G094900--Sobic003G245500 Sobic002G094900--Sobic008G073800 Sobic002G094900--Sobic009G078600 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic002G094900--Sobic005G213900 Sobic002G094900--Sobic007G024100 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic002G094900--Sobic008G071550 Sobic002G094900--Sobic008G182200 Sobic008G182200--Sobic002G162200 Sobic008G182200--Sobic008G071200 Sobic008G182200--Sobic004G015100 Sobic008G182200--Sobic003G245500 Sobic008G182200--Sobic005G153300 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic008G182200--Sobic002G162100 Sobic008G182200--Sobic002G053201 Sobic008G182200--Sobic008G073800 Sobic008G182200--Sobic007G024100 Sobic003G245500--Sobic008G182200 Sobic003G245500--Sobic009G078600 Sobic003G245500--Sobic002G053201 Sobic003G245500--Sobic002G162200 Sobic003G245500--Sobic008G071200 Sobic003G245500--Sobic007G024100 Sobic003G245500--Sobic004G015100 Sobic003G245500--Sobic002G094900 Sobic003G245500--Sobic008G073800 Sobic002G162200--Sobic008G071200 Sobic002G162200--Sobic005G153300 Sobic002G162200--Sobic008G182200 Sobic002G162200--Sobic004G015100 Sobic002G162200--Sobic002G162100 Sobic002G162200--Sobic003G245500 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic002G162200--Sobic005G200400 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic002G162200--Sobic006G144101 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic002G162200--Sobic002G345500 Sobic008G071200--Sobic002G162200 Sobic008G071200--Sobic005G153300 Sobic008G071200--Sobic008G182200 Sobic008G071200--Sobic004G015100 Sobic008G071200--Sobic002G162100 Sobic008G071200--Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic005G200400 Sobic008G071200--Sobic006G144101 Sobic008G071200--Sobic002G345500 Sobic004G015100--Sobic008G071200 Sobic004G015100--Sobic002G162200 Sobic004G015100--Sobic005G153300 Sobic004G015100--Sobic008G182200 Sobic004G015100--Sobic002G162100 Sobic004G015100--Sobic003G245500 Sobic004G015100--Sobic005G200400 Sobic004G015100--Sobic006G144101 Sobic004G015100--Sobic002G345500 Sobic005G153300--Sobic008G071200 Sobic005G153300--Sobic002G162200 Sobic005G153300--Sobic002G162100 Sobic005G153300--Sobic004G015100 Sobic005G153300--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic005G200400 Sobic005G153300--Sobic006G144101 Sobic005G153300--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic005G153300--Sobic004G090400 Sobic007G024100--Sobic003G245500 Sobic005G152700 Sobic005G152700 Sobic007G024100--Sobic005G152700 Sobic007G024100--Sobic002G053201 Sobic007G024100--Sobic002G094900 Sobic007G024100--Sobic009G078600 Sobic007G024100--Sobic008G182200 Sobic007G024100--Sobic002G162200 Sobic007G024100--Sobic008G071200 Sobic007G024100--Sobic008G073800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.