Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G153300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSP1 , C6JRZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G071200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
2 Sobic.002G162200 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.002G162100 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.004G015100 - -
5 Sobic.008G182200 - -
6 Sobic.005G200400 - -
7 Sobic.006G144101 - -
8 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.004G090400 - -
10 Sobic.003G245500 OsFBDUF5 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G074600 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.008G073800 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
14 Sobic.002G352501 - -
15 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
16 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
17 Sobic.002G053201 - -
18 Sobic.007G024100 - -
19 Sobic.001G324600 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.002G094900 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -


Gene co-expression network
sample Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic005G153300--Sobic008G071200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic005G153300--Sobic002G162200 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic005G153300--Sobic002G162100 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic005G153300--Sobic004G015100 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic008G182200 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic005G153300--Sobic005G200400 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic005G153300--Sobic006G144101 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic005G153300--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic005G153300--Sobic004G090400 Sobic008G071200--Sobic002G162200 Sobic008G071200--Sobic005G153300 Sobic008G071200--Sobic008G182200 Sobic008G071200--Sobic004G015100 Sobic008G071200--Sobic002G162100 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic005G200400 Sobic008G071200--Sobic006G144101 Sobic008G071200--Sobic002G345500 Sobic002G162200--Sobic008G071200 Sobic002G162200--Sobic005G153300 Sobic002G162200--Sobic008G182200 Sobic002G162200--Sobic004G015100 Sobic002G162200--Sobic002G162100 Sobic002G162200--Sobic003G245500 Sobic002G162200--Sobic005G200400 Sobic002G162200--Sobic006G144101 Sobic002G162200--Sobic002G345500 Sobic002G162100--Sobic005G153300 Sobic002G162100--Sobic005G200400 Sobic002G162100--Sobic008G071200 Sobic002G162100--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic006G144101 Sobic002G162100--Sobic002G345500 Sobic002G162100--Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G090400 Sobic002G162100--Sobic008G182200 Sobic004G015100--Sobic008G071200 Sobic004G015100--Sobic002G162200 Sobic004G015100--Sobic005G153300 Sobic004G015100--Sobic008G182200 Sobic004G015100--Sobic002G162100 Sobic004G015100--Sobic003G245500 Sobic004G015100--Sobic005G200400 Sobic004G015100--Sobic006G144101 Sobic004G015100--Sobic002G345500 Sobic008G182200--Sobic002G162200 Sobic008G182200--Sobic008G071200 Sobic008G182200--Sobic004G015100 Sobic008G182200--Sobic003G245500 Sobic008G182200--Sobic005G153300 Sobic008G182200--Sobic002G162100 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G182200--Sobic002G053201 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic008G182200--Sobic008G073800 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic008G182200--Sobic007G024100 Sobic005G200400--Sobic002G162100 Sobic005G200400--Sobic006G144101 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic005G200400--Sobic005G179700 Sobic005G200400--Sobic002G345500 Sobic005G200400--Sobic004G090400 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic005G200400--Sobic002G352501 Sobic005G200400--Sobic005G153300 Sobic005G200400--Sobic008G071200 Sobic005G200400--Sobic002G162200 Sobic006G144101--Sobic002G345500 Sobic006G144101--Sobic005G200400 Sobic006G144101--Sobic002G162100 Sobic006G144101--Sobic004G090400 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic002G352501 Sobic006G144101--Sobic005G179700 Sobic006G144101--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic006G144101 Sobic002G345500--Sobic004G090400 Sobic002G345500--Sobic005G200400 Sobic002G345500--Sobic002G162100 Sobic002G345500--Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic002G352501 Sobic002G345500--Sobic003G411100 Sobic002G345500--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic002G162200 Sobic004G090400--Sobic002G345500 Sobic004G090400--Sobic006G144101 Sobic004G090400--Sobic005G200400 Sobic004G090400--Sobic002G162100 Sobic004G090400--Sobic005G153300 Sobic004G090400--Sobic002G352501 Sobic004G090400--Sobic005G179700 Sobic004G090400--Sobic003G411100 Sobic004G090400--Sobic008G071200
Octagon: transcription factors


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