Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G094900.1
Synonym
Functional annotation DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family
UniProt A0A1B6QA44
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g20130.1 : DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G053201 - -
2 Sobic.003G207800 OsFBD2 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G245500 OsFBDUF5 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G073800 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
5 Sobic.009G078600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.005G213900 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.007G024100 - -
8 Sobic.008G071550 - -
9 Sobic.008G182200 - -
10 Sobic.005G141400 - -
11 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.002G162200 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.008G071200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
14 Sobic.004G015100 - -
15 Sobic.005G074600 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.005G153300 - -
17 Sobic.008G031000 LTPL26 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.010G008200 LTPL31 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.008G135800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.010G011300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic002G094900--Sobic002G053201 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic002G094900--Sobic003G207800 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic002G094900--Sobic003G245500 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic002G094900--Sobic008G073800 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic002G094900--Sobic009G078600 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic002G094900--Sobic005G213900 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic002G094900--Sobic007G024100 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic002G094900--Sobic008G071550 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic002G094900--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic002G094900 Sobic002G053201--Sobic003G245500 Sobic002G053201--Sobic008G073800 Sobic002G053201--Sobic007G024100 Sobic002G053201--Sobic009G078600 Sobic002G053201--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic003G207800 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic002G053201--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic002G053201--Sobic008G071200 Sobic003G207800--Sobic005G213900 Sobic003G207800--Sobic002G094900 Sobic003G207800--Sobic002G053201 Sobic005G141400 Sobic005G141400 Sobic003G207800--Sobic005G141400 Sobic003G207800--Sobic008G071550 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic003G207800--Sobic003G167566 Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic003G207800--Sobic010G008200 Sobic003G207800--Sobic009G078600 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic003G207800--Sobic009G210700 Sobic003G245500--Sobic008G182200 Sobic003G245500--Sobic009G078600 Sobic003G245500--Sobic002G053201 Sobic003G245500--Sobic002G162200 Sobic003G245500--Sobic008G071200 Sobic003G245500--Sobic007G024100 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic003G245500--Sobic004G015100 Sobic003G245500--Sobic002G094900 Sobic003G245500--Sobic008G073800 Sobic008G073800--Sobic002G053201 Sobic008G073800--Sobic002G094900 Sobic008G073800--Sobic008G182200 Sobic008G073800--Sobic003G245500 Sobic008G073800--Sobic002G162200 Sobic008G073800--Sobic008G071200 Sobic008G073800--Sobic004G015100 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic008G073800--Sobic005G153300 Sobic008G073800--Sobic007G024100 Sobic009G078600--Sobic003G245500 Sobic009G078600--Sobic008G071550 Sobic009G078600--Sobic002G053201 Sobic009G078600--Sobic002G094900 Sobic009G078600--Sobic007G024100 Sobic009G078600--Sobic005G141400 Sobic009G078600--Sobic008G182200 Sobic009G078600--Sobic005G213900 Sobic009G078600--Sobic008G073800 Sobic005G213900--Sobic005G141400 Sobic005G213900--Sobic003G207800 Sobic005G213900--Sobic010G008200 Sobic005G213900--Sobic008G071550 Sobic005G213900--Sobic002G094900 Sobic010G011300 Sobic010G011300 Sobic005G213900--Sobic010G011300 Sobic005G213900--Sobic003G167566 Sobic005G213900--Sobic009G078600 Sobic005G213900--Sobic002G053201 Sobic007G024100--Sobic003G245500 Sobic005G152700 Sobic005G152700 Sobic007G024100--Sobic005G152700 Sobic007G024100--Sobic002G053201 Sobic007G024100--Sobic002G094900 Sobic007G024100--Sobic009G078600 Sobic007G024100--Sobic008G182200 Sobic007G024100--Sobic002G162200 Sobic007G024100--Sobic008G071200 Sobic007G024100--Sobic008G073800 Sobic008G071550--Sobic005G141400 Sobic008G071550--Sobic009G078600 Sobic008G071550--Sobic010G008200 Sobic008G071550--Sobic010G011300 Sobic008G071550--Sobic005G213900 Sobic008G071550--Sobic003G245500 Sobic008G071550--Sobic002G094900 Sobic008G071550--Sobic002G053201 Sobic008G071550--Sobic007G024100 Sobic008G182200--Sobic002G162200 Sobic008G182200--Sobic008G071200 Sobic008G182200--Sobic004G015100 Sobic008G182200--Sobic003G245500 Sobic008G182200--Sobic005G153300 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic008G182200--Sobic002G162100 Sobic008G182200--Sobic002G053201 Sobic008G182200--Sobic008G073800 Sobic008G182200--Sobic007G024100
Octagon: transcription factors


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