Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G008200.1
Synonym
Functional annotation LTPL31 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A194YGN0
Pfam PF14368
Panther DB PTHR33286 PTHR33286:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33550 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g03870.1 : LTPL31 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.001G266300 POEI3 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.003G238900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.008G031000 LTPL26 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.008G073800 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I


Gene co-expression network
sample Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic010G011300 Sobic010G011300 Sobic010G008200--Sobic010G011300 Sobic005G141400 Sobic005G141400 Sobic010G008200--Sobic005G141400 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic010G008200--Sobic005G213900 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic010G008200--Sobic008G071550 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic010G008200--Sobic005G058400 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic010G008200--Sobic003G167566 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic010G008200--Sobic009G078600 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic010G008200--Sobic008G069600 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic010G008200--Sobic003G207800 Sobic010G011300--Sobic010G008200 Sobic010G011300--Sobic005G141400 Sobic010G011300--Sobic008G071550 Sobic010G011300--Sobic005G058400 Sobic010G011300--Sobic005G213900 Sobic010G011300--Sobic003G167566 Sobic010G011300--Sobic008G069600 Sobic010G011300--Sobic009G078600 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic010G011300--Sobic006G144201 Sobic005G141400--Sobic005G213900 Sobic005G141400--Sobic010G008200 Sobic005G141400--Sobic008G071550 Sobic005G141400--Sobic010G011300 Sobic005G141400--Sobic009G078600 Sobic005G141400--Sobic003G207800 Sobic005G141400--Sobic003G167566 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic005G141400--Sobic002G094900 Sobic005G141400--Sobic005G058400 Sobic005G213900--Sobic005G141400 Sobic005G213900--Sobic003G207800 Sobic005G213900--Sobic010G008200 Sobic005G213900--Sobic008G071550 Sobic005G213900--Sobic002G094900 Sobic005G213900--Sobic010G011300 Sobic005G213900--Sobic003G167566 Sobic005G213900--Sobic009G078600 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic005G213900--Sobic002G053201 Sobic008G071550--Sobic005G141400 Sobic008G071550--Sobic009G078600 Sobic008G071550--Sobic010G008200 Sobic008G071550--Sobic010G011300 Sobic008G071550--Sobic005G213900 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G071550--Sobic003G245500 Sobic008G071550--Sobic002G094900 Sobic008G071550--Sobic002G053201 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic008G071550--Sobic007G024100 Sobic005G058400--Sobic006G144201 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic005G058400--Sobic005G174800 Sobic005G058400--Sobic008G069600 Sobic005G058400--Sobic003G167566 Sobic005G058400--Sobic010G008200 Sobic005G058400--Sobic010G011300 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic005G058400--Sobic003G010000 Sobic005G058400--Sobic005G141400 Sobic001G266300 Sobic001G266300 Sobic005G058400--Sobic001G266300 Sobic003G167566--Sobic005G058400 Sobic003G167566--Sobic010G008200 Sobic003G167566--Sobic005G213900 Sobic003G167566--Sobic005G141400 Sobic003G167566--Sobic008G069600 Sobic003G167566--Sobic005G174800 Sobic003G167566--Sobic010G011300 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G207800 Sobic009G078600--Sobic003G245500 Sobic009G078600--Sobic008G071550 Sobic009G078600--Sobic002G053201 Sobic009G078600--Sobic002G094900 Sobic009G078600--Sobic007G024100 Sobic009G078600--Sobic005G141400 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic009G078600--Sobic008G182200 Sobic009G078600--Sobic005G213900 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic009G078600--Sobic008G073800 Sobic008G069600--Sobic005G058400 Sobic008G069600--Sobic006G144201 Sobic008G069600--Sobic005G174800 Sobic008G069600--Sobic003G167566 Sobic008G069600--Sobic003G010000 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic008G069600--Sobic008G070100 Sobic008G069600--Sobic010G008200 Sobic008G069600--Sobic010G011300 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G069600--Sobic004G048300 Sobic003G207800--Sobic005G213900 Sobic003G207800--Sobic002G094900 Sobic003G207800--Sobic002G053201 Sobic003G207800--Sobic005G141400 Sobic003G207800--Sobic008G071550 Sobic003G207800--Sobic003G167566 Sobic003G207800--Sobic010G008200 Sobic003G207800--Sobic009G078600 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic003G207800--Sobic009G210700
Octagon: transcription factors


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