Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G207800.1
Synonym Sb03g026910
Functional annotation OsFBD2 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt C5XQ68
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF76
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G26922 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41280.1 : OsFBD4 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028609
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G058400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic003G207800--Sobic005G213900 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic003G207800--Sobic002G094900 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic003G207800--Sobic002G053201 Sobic005G141400 Sobic005G141400 Sobic003G207800--Sobic005G141400 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic003G207800--Sobic008G071550 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic003G207800--Sobic003G167566 Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic003G207800--Sobic010G008200 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic003G207800--Sobic009G078600 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic003G207800--Sobic009G210700 Sobic005G213900--Sobic005G141400 Sobic005G213900--Sobic003G207800 Sobic005G213900--Sobic010G008200 Sobic005G213900--Sobic008G071550 Sobic005G213900--Sobic002G094900 Sobic010G011300 Sobic010G011300 Sobic005G213900--Sobic010G011300 Sobic005G213900--Sobic003G167566 Sobic005G213900--Sobic009G078600 Sobic005G213900--Sobic002G053201 Sobic002G094900--Sobic002G053201 Sobic002G094900--Sobic003G207800 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic002G094900--Sobic003G245500 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic002G094900--Sobic008G073800 Sobic002G094900--Sobic009G078600 Sobic002G094900--Sobic005G213900 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic002G094900--Sobic007G024100 Sobic002G094900--Sobic008G071550 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic002G094900--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic002G094900 Sobic002G053201--Sobic003G245500 Sobic002G053201--Sobic008G073800 Sobic002G053201--Sobic007G024100 Sobic002G053201--Sobic009G078600 Sobic002G053201--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic003G207800 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic002G053201--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic002G053201--Sobic008G071200 Sobic005G141400--Sobic005G213900 Sobic005G141400--Sobic010G008200 Sobic005G141400--Sobic008G071550 Sobic005G141400--Sobic010G011300 Sobic005G141400--Sobic009G078600 Sobic005G141400--Sobic003G207800 Sobic005G141400--Sobic003G167566 Sobic005G141400--Sobic002G094900 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic005G141400--Sobic005G058400 Sobic008G071550--Sobic005G141400 Sobic008G071550--Sobic009G078600 Sobic008G071550--Sobic010G008200 Sobic008G071550--Sobic010G011300 Sobic008G071550--Sobic005G213900 Sobic008G071550--Sobic003G245500 Sobic008G071550--Sobic002G094900 Sobic008G071550--Sobic002G053201 Sobic008G071550--Sobic007G024100 Sobic003G167566--Sobic005G058400 Sobic003G167566--Sobic010G008200 Sobic003G167566--Sobic005G213900 Sobic003G167566--Sobic005G141400 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic003G167566--Sobic008G069600 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic003G167566--Sobic005G174800 Sobic003G167566--Sobic010G011300 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G207800 Sobic010G008200--Sobic010G011300 Sobic010G008200--Sobic005G141400 Sobic010G008200--Sobic005G213900 Sobic010G008200--Sobic008G071550 Sobic010G008200--Sobic005G058400 Sobic010G008200--Sobic003G167566 Sobic010G008200--Sobic009G078600 Sobic010G008200--Sobic008G069600 Sobic010G008200--Sobic003G207800 Sobic009G078600--Sobic003G245500 Sobic009G078600--Sobic008G071550 Sobic009G078600--Sobic002G053201 Sobic009G078600--Sobic002G094900 Sobic009G078600--Sobic007G024100 Sobic009G078600--Sobic005G141400 Sobic009G078600--Sobic008G182200 Sobic009G078600--Sobic005G213900 Sobic009G078600--Sobic008G073800 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic009G210700--Sobic006G139400 Sobic009G210700--Sobic003G238900 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic009G210700--Sobic008G045700 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic009G210700--Sobic001G438300 Sobic009G210700--Sobic003G207800 Sobic009G210700--Sobic003G167566 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic009G210700--Sobic001G183300 Sobic009G210700--Sobic005G213900 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic009G210700--Sobic007G040500
Octagon: transcription factors


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