Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G135800.1
Synonym Sb08g018740
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5YPY9
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF241
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28600 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46220.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004243
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G048400 - -
2 Sobic.001G438300 aspartic proteinase, putative, expressed -
3 Sobic.007G040500 - -
4 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.002G094900 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
7 Sobic.002G053201 - -
8 Sobic.001G183300 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G207800 OsFBD2 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G050300 expressed protein -
11 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.008G073800 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
13 Sobic.008G045700 PHD-finger family protein, expressed -
14 Sobic.004G090400 - -
15 Sobic.005G082400 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.005G150100 - -
18 Sobic.005G074600 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.007G047000 hypothetical protein -
20 Sobic.005G153300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic008G135800--Sobic004G048400 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic008G135800--Sobic001G438300 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic008G135800--Sobic007G040500 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic008G135800--Sobic005G133100 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic008G135800--Sobic005G212000 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic008G135800--Sobic002G094900 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G135800--Sobic002G053201 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic008G135800--Sobic001G183300 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic008G135800--Sobic003G207800 Sobic004G048400--Sobic007G040500 Sobic004G048400--Sobic001G438300 Sobic004G048400--Sobic008G135800 Sobic004G048400--Sobic005G133100 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic004G048400--Sobic005G082400 Sobic004G048400--Sobic001G183300 Sobic004G048400--Sobic005G212000 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic004G048400--Sobic007G047000 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic004G048400--Sobic008G045700 Sobic001G438300--Sobic007G040500 Sobic001G438300--Sobic004G048400 Sobic001G438300--Sobic001G183300 Sobic001G438300--Sobic008G135800 Sobic001G438300--Sobic008G045700 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic001G438300--Sobic009G210700 Sobic001G438300--Sobic005G082400 Sobic001G438300--Sobic003G207800 Sobic001G438300--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic004G048400 Sobic007G040500--Sobic001G438300 Sobic007G040500--Sobic005G082400 Sobic007G040500--Sobic001G183300 Sobic007G040500--Sobic008G135800 Sobic007G040500--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic008G045700 Sobic007G040500--Sobic009G210700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic007G040500--Sobic001G323500 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G133100--Sobic009G039000 Sobic005G212000--Sobic008G050300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic005G212000--Sobic005G150100 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic005G212000--Sobic004G076400 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic007G040600 Sobic005G212000--Sobic005G133100 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G212000--Sobic005G147200 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G212000--Sobic002G250800 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G212000--Sobic004G221700 Sobic002G094900--Sobic002G053201 Sobic002G094900--Sobic003G207800 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic002G094900--Sobic003G245500 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic002G094900--Sobic008G073800 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic002G094900--Sobic009G078600 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic002G094900--Sobic005G213900 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic002G094900--Sobic007G024100 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic002G094900--Sobic008G071550 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic002G094900--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic002G094900 Sobic002G053201--Sobic003G245500 Sobic002G053201--Sobic008G073800 Sobic002G053201--Sobic007G024100 Sobic002G053201--Sobic009G078600 Sobic002G053201--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic003G207800 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic002G053201--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic002G053201--Sobic008G071200 Sobic001G183300--Sobic001G438300 Sobic001G183300--Sobic007G040500 Sobic001G183300--Sobic004G048400 Sobic001G183300--Sobic008G045700 Sobic001G183300--Sobic005G082400 Sobic001G183300--Sobic009G210700 Sobic001G183300--Sobic008G135800 Sobic001G183300--Sobic001G323500 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic001G183300--Sobic006G139400 Sobic003G207800--Sobic005G213900 Sobic003G207800--Sobic002G094900 Sobic003G207800--Sobic002G053201 Sobic005G141400 Sobic005G141400 Sobic003G207800--Sobic005G141400 Sobic003G207800--Sobic008G071550 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic003G207800--Sobic003G167566 Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic003G207800--Sobic010G008200 Sobic003G207800--Sobic009G078600 Sobic003G207800--Sobic009G210700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.