Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G048400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YNU7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.004G048400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G040500 - -
2 Sobic.001G438300 aspartic proteinase, putative, expressed -
3 Sobic.008G135800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G082400 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.001G183300 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.007G047000 hypothetical protein -
9 Sobic.008G045700 PHD-finger family protein, expressed -
10 Sobic.008G050300 expressed protein -
11 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.007G040600 - -
13 Sobic.003G207800 OsFBD2 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G210700 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.002G094900 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
16 Sobic.005G150100 - -
17 Sobic.002G053201 - -
18 Sobic.001G323500 expressed protein -
19 Sobic.008G073800 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
20 Sobic.007G205300 AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic004G048400--Sobic007G040500 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic004G048400--Sobic001G438300 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic004G048400--Sobic008G135800 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic004G048400--Sobic005G133100 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic004G048400--Sobic005G082400 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic004G048400--Sobic001G183300 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic004G048400--Sobic005G212000 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic004G048400--Sobic007G047000 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic004G048400--Sobic008G045700 Sobic007G040500--Sobic004G048400 Sobic007G040500--Sobic001G438300 Sobic007G040500--Sobic005G082400 Sobic007G040500--Sobic001G183300 Sobic007G040500--Sobic008G135800 Sobic007G040500--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic008G045700 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic007G040500--Sobic009G210700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic007G040500--Sobic001G323500 Sobic001G438300--Sobic007G040500 Sobic001G438300--Sobic004G048400 Sobic001G438300--Sobic001G183300 Sobic001G438300--Sobic008G135800 Sobic001G438300--Sobic008G045700 Sobic001G438300--Sobic009G210700 Sobic001G438300--Sobic005G082400 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic001G438300--Sobic003G207800 Sobic001G438300--Sobic005G133100 Sobic008G135800--Sobic004G048400 Sobic008G135800--Sobic001G438300 Sobic008G135800--Sobic007G040500 Sobic008G135800--Sobic005G133100 Sobic008G135800--Sobic005G212000 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic008G135800--Sobic002G094900 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G135800--Sobic002G053201 Sobic008G135800--Sobic001G183300 Sobic008G135800--Sobic003G207800 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G133100--Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic007G040500 Sobic005G082400--Sobic004G048400 Sobic005G082400--Sobic005G133100 Sobic005G082400--Sobic001G438300 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G082400--Sobic006G276401 Sobic005G082400--Sobic001G183300 Sobic005G082400--Sobic001G323500 Sobic005G082400--Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic008G045700 Sobic001G183300--Sobic001G438300 Sobic001G183300--Sobic007G040500 Sobic001G183300--Sobic004G048400 Sobic001G183300--Sobic008G045700 Sobic001G183300--Sobic005G082400 Sobic001G183300--Sobic009G210700 Sobic001G183300--Sobic008G135800 Sobic001G183300--Sobic001G323500 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic001G183300--Sobic006G139400 Sobic005G212000--Sobic008G050300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic005G212000--Sobic005G150100 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic005G212000--Sobic004G076400 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic007G040600 Sobic005G212000--Sobic005G133100 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G212000--Sobic005G147200 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G212000--Sobic002G250800 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G212000--Sobic004G221700 Sobic007G047000--Sobic009G039000 Sobic007G047000--Sobic005G133100 Sobic007G047000--Sobic004G048400 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic007G047000--Sobic005G074700 Sobic007G047000--Sobic005G212000 Sobic007G047000--Sobic002G250800 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic007G047000--Sobic007G109000 Sobic007G047000--Sobic007G040500 Sobic007G047000--Sobic005G082400 Sobic008G045700--Sobic009G210700 Sobic008G045700--Sobic001G438300 Sobic008G045700--Sobic006G139400 Sobic008G045700--Sobic007G040500 Sobic008G045700--Sobic001G183300 Sobic008G045700--Sobic001G323500 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic008G045700--Sobic003G238900 Sobic008G045700--Sobic004G048400 Sobic008G045700--Sobic005G082400
Octagon: transcription factors


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