Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G047000.1
Synonym
Functional annotation hypothetical protein
UniProt A0A1B6PFW5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) ChrUn.fgenesh.mRNA.41 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
2 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G048400 - -
4 Sobic.005G074700 LTPL32 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
5 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.002G250800 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
7 Sobic.007G109000 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
8 Sobic.007G040500 - -
9 Sobic.005G082400 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.007G040600 - -
11 Sobic.008G050300 expressed protein -
12 Sobic.008G135800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
14 Sobic.001G438300 aspartic proteinase, putative, expressed -
15 Sobic.003G415700 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G205300 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G183300 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G150100 - -
19 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
20 Sobic.005G147032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic007G047000--Sobic009G039000 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic007G047000--Sobic005G133100 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic007G047000--Sobic004G048400 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic007G047000--Sobic005G074700 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic007G047000--Sobic005G212000 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic007G047000--Sobic002G250800 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic007G047000--Sobic007G109000 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic007G047000--Sobic007G040500 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic007G047000--Sobic005G082400 Sobic009G039000--Sobic007G047000 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic009G039000--Sobic004G017700 Sobic009G039000--Sobic007G109000 Sobic009G039000--Sobic005G082400 Sobic009G039000--Sobic005G133100 Sobic009G039000--Sobic005G074700 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic009G039000--Sobic005G147700 Sobic009G039000--Sobic007G040500 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic009G039000--Sobic006G276401 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic009G039000 Sobic004G048400--Sobic007G040500 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic004G048400--Sobic001G438300 Sobic004G048400--Sobic008G135800 Sobic004G048400--Sobic005G133100 Sobic004G048400--Sobic005G082400 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic004G048400--Sobic001G183300 Sobic004G048400--Sobic005G212000 Sobic004G048400--Sobic007G047000 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic004G048400--Sobic008G045700 Sobic005G074700--Sobic007G109000 Sobic005G074700--Sobic007G047000 Sobic005G074700--Sobic009G039000 Sobic005G074700--Sobic004G017700 Sobic010G119100 Sobic010G119100 Sobic005G074700--Sobic010G119100 Sobic005G074700--Sobic002G250800 Sobic002G345600 Sobic002G345600 Sobic005G074700--Sobic002G345600 Sobic010G069800 Sobic010G069800 Sobic005G074700--Sobic010G069800 Sobic005G152932 Sobic005G152932 Sobic005G074700--Sobic005G152932 Sobic005G212000--Sobic008G050300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic005G212000--Sobic005G150100 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic005G212000--Sobic004G076400 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic007G040600 Sobic005G212000--Sobic005G133100 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G212000--Sobic005G147200 Sobic005G212000--Sobic002G250800 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G212000--Sobic004G221700 Sobic002G250800--Sobic007G040600 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic002G250800--Sobic008G126300 Sobic002G250800--Sobic005G212000 Sobic002G250800--Sobic008G050300 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic002G250800--Sobic004G076600 Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic002G250800--Sobic005G227800 Sobic002G250800--Sobic005G147032 Sobic002G250800--Sobic005G147200 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic002G250800--Sobic010G029600 Sobic007G109000--Sobic009G039000 Sobic007G109000--Sobic005G074700 Sobic007G109000--Sobic010G119100 Sobic007G109000--Sobic004G017700 Sobic007G109000--Sobic007G047000 Sobic007G109000--Sobic005G152932 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic007G109000--Sobic005G148700 Sobic007G109000--Sobic005G082400 Sobic007G109000--Sobic006G276401 Sobic007G040500--Sobic004G048400 Sobic007G040500--Sobic001G438300 Sobic007G040500--Sobic005G082400 Sobic007G040500--Sobic001G183300 Sobic007G040500--Sobic008G135800 Sobic007G040500--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic008G045700 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic007G040500--Sobic009G210700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic007G040500--Sobic001G323500 Sobic005G082400--Sobic007G040500 Sobic005G082400--Sobic004G048400 Sobic005G082400--Sobic005G133100 Sobic005G082400--Sobic001G438300 Sobic005G082400--Sobic006G276401 Sobic005G082400--Sobic001G183300 Sobic005G082400--Sobic001G323500 Sobic005G082400--Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic008G045700
Octagon: transcription factors


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