Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G212000.1
Synonym
Functional annotation LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt C5Y7K4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13960.1 : LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G212000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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2 Sobic.005G150100 - -
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10 Sobic.005G227800 - -
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13 Sobic.005G098300 OsIAA29 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
14 Sobic.010G010500 - -
15 Sobic.008G135800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
16 Sobic.004G048400 - -
17 Sobic.008G126300 - -
18 Sobic.005G147100 - -
19 Sobic.007G047000 hypothetical protein -
20 Sobic.005G027100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G212000--Sobic008G050300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic005G212000--Sobic005G150100 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic005G212000--Sobic004G076400 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic005G147032 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G212000--Sobic007G040600 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic005G212000--Sobic005G133100 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G212000--Sobic005G147200 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G212000--Sobic002G250800 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G212000--Sobic004G221700 Sobic008G050300--Sobic005G212000 Sobic008G050300--Sobic005G150100 Sobic008G050300--Sobic005G147032 Sobic008G050300--Sobic007G040600 Sobic008G050300--Sobic004G076400 Sobic008G050300--Sobic005G147200 Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic008G050300--Sobic005G227800 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic008G050300--Sobic010G029600 Sobic008G050300--Sobic005G133100 Sobic005G150100--Sobic004G076400 Sobic005G150100--Sobic005G147032 Sobic005G150100--Sobic008G050300 Sobic005G150100--Sobic005G212000 Sobic005G150100--Sobic005G147200 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic005G150100--Sobic005G098300 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic005G150100--Sobic010G010500 Sobic005G150100--Sobic004G221700 Sobic005G150100--Sobic010G029600 Sobic004G076400--Sobic005G150100 Sobic004G076400--Sobic005G098300 Sobic004G076400--Sobic004G221700 Sobic004G076400--Sobic010G010500 Sobic004G076400--Sobic005G147032 Sobic002G151700 Sobic002G151700 Sobic004G076400--Sobic002G151700 Sobic004G076400--Sobic005G147200 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic004G076400--Sobic005G147100 Sobic004G076400--Sobic008G050300 Sobic005G147032--Sobic005G147200 Sobic005G147032--Sobic005G150100 Sobic005G147032--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G227800 Sobic005G147032--Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic010G010500 Sobic005G147032--Sobic005G147100 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic005G147032--Sobic005G221100 Sobic005G147032--Sobic005G098300 Sobic007G040600--Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic002G250800 Sobic007G040600--Sobic005G212000 Sobic007G040600--Sobic005G133100 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic007G040600--Sobic008G126300 Sobic007G040600--Sobic005G150100 Sobic007G040600--Sobic005G147032 Sobic007G040600--Sobic005G227800 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic007G040600--Sobic005G221300 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G133100--Sobic009G039000 Sobic005G147200--Sobic010G029600 Sobic005G147200--Sobic005G147032 Sobic005G147200--Sobic005G227800 Sobic005G147200--Sobic005G221100 Sobic005G147200--Sobic005G147100 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic005G147200--Sobic005G223000 Sobic005G147200--Sobic010G010500 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic005G147200--Sobic005G145900 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic005G147200--Sobic008G045650 Sobic002G250800--Sobic007G040600 Sobic002G250800--Sobic008G126300 Sobic002G250800--Sobic005G212000 Sobic002G250800--Sobic008G050300 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic002G250800--Sobic004G076600 Sobic002G250800--Sobic005G227800 Sobic002G250800--Sobic005G147032 Sobic002G250800--Sobic005G147200 Sobic002G250800--Sobic010G029600 Sobic004G221700--Sobic004G076400 Sobic004G221700--Sobic005G098300 Sobic004G221700--Sobic002G151700 Sobic004G221700--Sobic010G010500 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic004G221700--Sobic005G027100 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic004G221700--Sobic005G081800 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic004G221700--Sobic002G352501 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic004G221700--Sobic005G064400 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic004G221700--Sobic005G179700
Octagon: transcription factors


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