Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G040600.1
Synonym Sb07g003410
Functional annotation -
UniProt C5YGU9
Pfam PF06639
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055209 , Zm00025a055208
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G050300 expressed protein -
2 Sobic.002G250800 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
3 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
4 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G126300 - -
6 Sobic.005G150100 - -
7 Sobic.005G147032 - -
8 Sobic.005G227800 - -
9 Sobic.005G221300 - -
10 Sobic.004G076600 zinc-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G029600 histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
12 Sobic.005G147200 - -
13 Sobic.004G076400 zinc-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G047000 hypothetical protein -
15 Sobic.004G048400 - -
16 Sobic.007G205300 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G221100 - -
18 Sobic.005G145900 - -
19 Sobic.009G039200 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.010G010500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic008G050300 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic007G040600--Sobic002G250800 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic007G040600--Sobic005G212000 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic007G040600--Sobic005G133100 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic007G040600--Sobic008G126300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic007G040600--Sobic005G150100 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic007G040600--Sobic005G147032 Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic007G040600--Sobic005G227800 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic007G040600--Sobic005G221300 Sobic008G050300--Sobic005G212000 Sobic008G050300--Sobic005G150100 Sobic008G050300--Sobic005G147032 Sobic008G050300--Sobic007G040600 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic008G050300--Sobic004G076400 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic008G050300--Sobic005G147200 Sobic008G050300--Sobic005G227800 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic008G050300--Sobic010G029600 Sobic008G050300--Sobic005G133100 Sobic002G250800--Sobic007G040600 Sobic002G250800--Sobic008G126300 Sobic002G250800--Sobic005G212000 Sobic002G250800--Sobic008G050300 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic002G250800--Sobic004G076600 Sobic002G250800--Sobic005G227800 Sobic002G250800--Sobic005G147032 Sobic002G250800--Sobic005G147200 Sobic002G250800--Sobic010G029600 Sobic005G212000--Sobic008G050300 Sobic005G212000--Sobic005G150100 Sobic005G212000--Sobic004G076400 Sobic005G212000--Sobic005G147032 Sobic005G212000--Sobic007G040600 Sobic005G212000--Sobic005G133100 Sobic005G212000--Sobic005G147200 Sobic005G212000--Sobic002G250800 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G212000--Sobic004G221700 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G133100--Sobic009G039000 Sobic008G126300--Sobic004G076600 Sobic008G126300--Sobic005G227800 Sobic008G126300--Sobic010G029600 Sobic008G126300--Sobic005G147200 Sobic008G126300--Sobic005G147032 Sobic008G126300--Sobic007G040600 Sobic008G126300--Sobic002G250800 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic008G126300--Sobic005G221100 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic008G126300--Sobic005G145900 Sobic005G150100--Sobic004G076400 Sobic005G150100--Sobic005G147032 Sobic005G150100--Sobic008G050300 Sobic005G150100--Sobic005G212000 Sobic005G150100--Sobic005G147200 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic005G150100--Sobic005G098300 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic005G150100--Sobic010G010500 Sobic005G150100--Sobic004G221700 Sobic005G150100--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G147200 Sobic005G147032--Sobic005G150100 Sobic005G147032--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G227800 Sobic005G147032--Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic010G010500 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic005G147032--Sobic005G147100 Sobic005G147032--Sobic005G221100 Sobic005G147032--Sobic005G098300 Sobic005G227800--Sobic010G029600 Sobic005G227800--Sobic005G147200 Sobic005G227800--Sobic004G076600 Sobic005G227800--Sobic005G147032 Sobic005G227800--Sobic005G221100 Sobic005G227800--Sobic005G145900 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic005G227800--Sobic008G045650 Sobic005G227800--Sobic008G126300 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic005G227800--Sobic005G223000 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G221300--Sobic004G198550 Sobic005G221300--Sobic007G040600 Sobic005G221300--Sobic002G250800 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G221300--Sobic002G089600 Sobic005G221300--Sobic008G126300 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic005G221300--Sobic007G205300 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G221300--Sobic005G146200 Sobic005G221300--Sobic005G133100 Sobic005G221300--Sobic004G076600
Octagon: transcription factors


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