Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G221300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PU26
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G198550 - -
2 Sobic.007G040600 - -
3 Sobic.002G250800 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
4 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.008G126300 - -
6 Sobic.007G205300 AP2 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G146200 - -
8 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G076600 zinc-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G147700 - -
11 Sobic.008G050300 expressed protein -
12 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
13 Sobic.003G065800 expressed protein -
14 Sobic.005G227800 - -
15 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.007G047000 hypothetical protein -
17 Sobic.005G147032 - -
18 Sobic.010G029600 histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
19 Sobic.005G082400 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.005G150100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G221300--Sobic004G198550 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G221300--Sobic007G040600 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G221300--Sobic002G250800 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G221300--Sobic002G089600 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic005G221300--Sobic008G126300 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic005G221300--Sobic007G205300 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G221300--Sobic005G146200 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic005G221300--Sobic005G133100 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic005G221300--Sobic004G076600 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic004G198550--Sobic004G017700 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic002G250800 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic007G040600--Sobic005G212000 Sobic007G040600--Sobic005G133100 Sobic007G040600--Sobic008G126300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic007G040600--Sobic005G150100 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic007G040600--Sobic005G147032 Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic007G040600--Sobic005G227800 Sobic007G040600--Sobic005G221300 Sobic002G250800--Sobic007G040600 Sobic002G250800--Sobic008G126300 Sobic002G250800--Sobic005G212000 Sobic002G250800--Sobic008G050300 Sobic002G250800--Sobic004G076600 Sobic002G250800--Sobic005G227800 Sobic002G250800--Sobic005G147032 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic002G250800--Sobic005G147200 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic002G250800--Sobic010G029600 Sobic002G089600--Sobic004G198550 Sobic002G089600--Sobic005G147700 Sobic002G089600--Sobic005G221300 Sobic002G089600--Sobic007G205300 Sobic002G089600--Sobic005G146200 Sobic002G089600--Sobic009G039000 Sobic002G089600--Sobic006G276401 Sobic002G089600--Sobic004G017700 Sobic002G089600--Sobic005G133100 Sobic008G126300--Sobic004G076600 Sobic008G126300--Sobic005G227800 Sobic008G126300--Sobic010G029600 Sobic008G126300--Sobic005G147200 Sobic008G126300--Sobic005G147032 Sobic008G126300--Sobic007G040600 Sobic008G126300--Sobic002G250800 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic008G126300--Sobic005G221100 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic008G126300--Sobic005G145900 Sobic007G205300--Sobic005G133100 Sobic007G205300--Sobic002G089600 Sobic007G205300--Sobic004G198550 Sobic007G205300--Sobic007G040600 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic007G205300--Sobic005G082400 Sobic007G205300--Sobic005G221300 Sobic007G205300--Sobic009G039000 Sobic007G205300--Sobic005G147700 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic007G205300--Sobic004G048400 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic009G039000 Sobic004G076600--Sobic008G126300 Sobic004G076600--Sobic005G227800 Sobic004G076600--Sobic010G029600 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic004G076600--Sobic008G045650 Sobic004G076600--Sobic005G145900 Sobic004G076600--Sobic005G221100 Sobic004G076600--Sobic005G147200 Sobic004G076600--Sobic005G147032 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic004G076600--Sobic005G223000
Octagon: transcription factors


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