Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G198550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNA2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G146200 - -
2 Sobic.005G221300 - -
3 Sobic.005G147700 - -
4 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.007G205300 AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
7 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.006G276401 - -
9 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
10 Sobic.007G040600 - -
11 Sobic.005G133100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G082400 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.002G010700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.002G250800 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
15 Sobic.005G173532 - -
16 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
17 Sobic.005G148700 - -
18 Sobic.007G047000 hypothetical protein -
19 Sobic.009G051101 - -
20 Sobic.005G109500 cycloartenol synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic004G198550--Sobic004G017700 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic005G221300--Sobic004G198550 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G221300--Sobic007G040600 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G221300--Sobic002G250800 Sobic005G221300--Sobic002G089600 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic005G221300--Sobic008G126300 Sobic005G221300--Sobic007G205300 Sobic005G221300--Sobic005G146200 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic005G221300--Sobic005G133100 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic005G221300--Sobic004G076600 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic002G089600--Sobic004G198550 Sobic002G089600--Sobic005G147700 Sobic002G089600--Sobic005G221300 Sobic002G089600--Sobic007G205300 Sobic002G089600--Sobic005G146200 Sobic002G089600--Sobic009G039000 Sobic002G089600--Sobic006G276401 Sobic002G089600--Sobic004G017700 Sobic002G089600--Sobic005G133100 Sobic007G205300--Sobic005G133100 Sobic007G205300--Sobic002G089600 Sobic007G205300--Sobic004G198550 Sobic007G205300--Sobic007G040600 Sobic007G205300--Sobic005G082400 Sobic007G205300--Sobic005G221300 Sobic007G205300--Sobic009G039000 Sobic007G205300--Sobic005G147700 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic007G205300--Sobic004G048400 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic009G039000--Sobic007G047000 Sobic009G039000--Sobic004G017700 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic009G039000--Sobic007G109000 Sobic009G039000--Sobic005G082400 Sobic009G039000--Sobic005G133100 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic009G039000--Sobic005G074700 Sobic009G039000--Sobic005G147700 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic009G039000--Sobic007G040500 Sobic009G039000--Sobic006G276401 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic004G017700--Sobic009G039000 Sobic004G017700--Sobic005G148700 Sobic004G017700--Sobic007G109000 Sobic004G017700--Sobic005G147700 Sobic004G017700--Sobic006G276401 Sobic004G017700--Sobic005G074700 Sobic004G017700--Sobic007G047000 Sobic004G017700--Sobic005G221200 Sobic004G017700--Sobic005G082400
Octagon: transcription factors


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