Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G276401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RFV1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G147700 - -
2 Sobic.005G148700 - -
3 Sobic.001G323500 expressed protein -
4 Sobic.005G221200 - -
5 Sobic.005G141500 - -
6 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
7 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
8 Sobic.005G082400 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
10 Sobic.005G174600 - -
11 Sobic.009G017732 - -
12 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
13 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.003G135201 - -
15 Sobic.004G198550 - -
16 Sobic.007G040500 - -
17 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
19 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
20 Sobic.007G205300 AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G148700--Sobic004G017700 Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic006G276401 Sobic001G323500--Sobic005G148700 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic001G323500--Sobic005G177200 Sobic001G323500--Sobic005G082400 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic001G323500--Sobic008G045700 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic001G323500--Sobic006G139400 Sobic001G323500--Sobic005G141500 Sobic001G323500--Sobic005G221200 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic005G141500--Sobic005G221200 Sobic005G141500--Sobic005G174600 Sobic005G141500--Sobic005G109900 Sobic005G141500--Sobic009G006800 Sobic005G141500--Sobic009G039700 Sobic005G141500--Sobic003G135201 Sobic005G141500--Sobic005G148700 Sobic005G141500--Sobic005G109800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic005G141500--Sobic010G137700 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic005G082400--Sobic007G040500 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic005G082400--Sobic004G048400 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic005G082400--Sobic005G133100 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic005G082400--Sobic001G438300 Sobic005G082400--Sobic006G276401 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic005G082400--Sobic001G183300 Sobic005G082400--Sobic001G323500 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic008G045700 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic005G109900--Sobic003G135201
Octagon: transcription factors


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