Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G174700.1
Synonym
Functional annotation DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6PT55
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
2 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
3 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
4 Sobic.005G147700 - -
5 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G221200 - -
7 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
8 Sobic.006G276401 - -
9 Sobic.005G141500 - -
10 Sobic.005G174600 - -
11 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
12 Sobic.005G148700 - -
13 Sobic.005G146200 - -
14 Sobic.002G010700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.004G198550 - -
16 Sobic.003G135201 - -
17 Sobic.009G006800 eukaryotic initiation factor iso-4F subunit p82-34, putative, expressed -
18 Sobic.003G438300 - -
19 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
20 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic009G039500--Sobic002G061200 Sobic009G039500--Sobic005G109800 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic005G109900 Sobic009G039500--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic009G039500--Sobic005G174600 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic009G039700 Sobic009G039500--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic002G061200--Sobic007G109400 Sobic002G061200--Sobic009G039500 Sobic002G061200--Sobic005G109800 Sobic002G061200--Sobic003G438300 Sobic002G061200--Sobic005G109900 Sobic002G061200--Sobic005G174700 Sobic002G061200--Sobic005G174600 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic002G061200--Sobic010G195600 Sobic002G061200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic005G141500--Sobic005G221200 Sobic005G141500--Sobic005G174600 Sobic005G141500--Sobic005G109900 Sobic005G141500--Sobic009G006800 Sobic005G141500--Sobic009G039700 Sobic005G141500--Sobic003G135201 Sobic005G141500--Sobic005G148700 Sobic005G141500--Sobic005G109800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic005G141500--Sobic010G137700
Octagon: transcription factors


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