Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G006800.2
Synonym
Functional annotation eukaryotic initiation factor iso-4F subunit p82-34, putative, expressed
UniProt A0A1B6P5X8
Pfam -
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g10550.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G415800 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.010G137700 - -
3 Sobic.005G174600 - -
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5 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
6 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
7 Sobic.003G135201 - -
8 Sobic.005G221200 - -
9 Sobic.001G270600 - -
10 Sobic.001G301100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.005G153500 - -
13 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G040000 - -
16 Sobic.002G049800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
17 Sobic.005G173900 - -
18 Sobic.002G302200 expressed protein -
19 Sobic.009G090250 - -
20 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family


Gene co-expression network
sample Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic009G006800--Sobic003G415800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic009G006800--Sobic010G137700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic009G006800--Sobic005G174600 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic009G006800--Sobic005G141500 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic009G006800--Sobic005G109900 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic009G006800--Sobic005G109800 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic009G006800--Sobic003G135201 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic009G006800--Sobic005G221200 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic009G006800--Sobic001G270600 Sobic003G415800--Sobic009G006800 Sobic003G415800--Sobic001G270600 Sobic003G415800--Sobic005G109800 Sobic003G415800--Sobic005G174600 Sobic003G415800--Sobic010G137700 Sobic003G415800--Sobic005G109900 Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic003G415800--Sobic001G301100 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic003G415800--Sobic003G321500 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic003G415800--Sobic007G040000 Sobic010G137700--Sobic009G006800 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic010G137700--Sobic002G049800 Sobic010G137700--Sobic005G141500 Sobic010G137700--Sobic003G135201 Sobic010G137700--Sobic003G415800 Sobic010G137700--Sobic005G174600 Sobic010G137700--Sobic005G221200 Sobic010G137700--Sobic005G109900 Sobic010G137700--Sobic001G270600 Sobic005G174600--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G109900 Sobic005G174600--Sobic009G006800 Sobic005G174600--Sobic005G109800 Sobic005G174600--Sobic003G135201 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G174600--Sobic009G039700 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic003G415800 Sobic005G141500--Sobic005G221200 Sobic005G141500--Sobic005G174600 Sobic005G141500--Sobic005G109900 Sobic005G141500--Sobic009G006800 Sobic005G141500--Sobic009G039700 Sobic005G141500--Sobic003G135201 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic005G141500--Sobic005G148700 Sobic005G141500--Sobic005G109800 Sobic005G141500--Sobic010G137700 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200 Sobic003G135201--Sobic005G141500 Sobic003G135201--Sobic009G006800 Sobic003G135201--Sobic005G174600 Sobic003G135201--Sobic005G109900 Sobic003G135201--Sobic005G221200 Sobic003G135201--Sobic010G137700 Sobic003G135201--Sobic005G109800 Sobic003G135201--Sobic003G415800 Sobic003G135201--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic001G270600--Sobic009G090250 Sobic001G270600--Sobic007G040000 Sobic001G270600--Sobic003G321500 Sobic001G270600--Sobic003G415800 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic001G270600--Sobic001G246400 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic001G270600--Sobic005G173900 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic001G270600--Sobic006G117300 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic001G270600--Sobic005G174500 Sobic001G270600--Sobic009G006800
Octagon: transcription factors


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