Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G301100.1
Synonym Sb01g029290
Functional annotation myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
UniProt C5WSF4
Pfam PF00249
Panther DB PTHR12374 PTHR12374:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38090 : Duplicated homeodomain-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g07650.1 : myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G301100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.005G149800 - -
19 Sobic.007G040000 - -
20 Sobic.003G321500 Homeobox domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic001G301100--Sobic009G006800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic001G301100--Sobic003G415800 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic001G301100--Sobic009G039700 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic001G301100--Sobic005G109800 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic001G301100--Sobic005G174600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic001G301100--Sobic005G109900 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic001G301100--Sobic010G137700 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic001G301100--Sobic005G141500 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic001G301100--Sobic001G270600 Sobic009G006800--Sobic003G415800 Sobic009G006800--Sobic010G137700 Sobic009G006800--Sobic005G174600 Sobic009G006800--Sobic005G141500 Sobic009G006800--Sobic005G109900 Sobic009G006800--Sobic005G109800 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic009G006800--Sobic003G135201 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic009G006800--Sobic005G221200 Sobic009G006800--Sobic001G270600 Sobic003G415800--Sobic009G006800 Sobic003G415800--Sobic001G270600 Sobic003G415800--Sobic005G109800 Sobic003G415800--Sobic005G174600 Sobic003G415800--Sobic010G137700 Sobic003G415800--Sobic005G109900 Sobic003G415800--Sobic001G301100 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic003G415800--Sobic003G321500 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic003G415800--Sobic007G040000 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G109900 Sobic005G174600--Sobic009G006800 Sobic005G174600--Sobic005G109800 Sobic005G174600--Sobic003G135201 Sobic005G174600--Sobic009G039700 Sobic005G174600--Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic003G415800 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic010G137700--Sobic009G006800 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic010G137700--Sobic002G049800 Sobic010G137700--Sobic005G141500 Sobic010G137700--Sobic003G135201 Sobic010G137700--Sobic003G415800 Sobic010G137700--Sobic005G174600 Sobic010G137700--Sobic005G221200 Sobic010G137700--Sobic005G109900 Sobic010G137700--Sobic001G270600 Sobic005G141500--Sobic005G221200 Sobic005G141500--Sobic005G174600 Sobic005G141500--Sobic005G109900 Sobic005G141500--Sobic009G006800 Sobic005G141500--Sobic009G039700 Sobic005G141500--Sobic003G135201 Sobic005G141500--Sobic005G148700 Sobic005G141500--Sobic005G109800 Sobic005G141500--Sobic010G137700 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic001G270600--Sobic009G090250 Sobic001G270600--Sobic007G040000 Sobic001G270600--Sobic003G321500 Sobic001G270600--Sobic003G415800 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic001G270600--Sobic001G246400 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic001G270600--Sobic005G173900 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic001G270600--Sobic006G117300 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic001G270600--Sobic005G174500 Sobic001G270600--Sobic009G006800
Octagon: transcription factors


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