Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G135201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VX94
Pfam PF08711
Panther DB PTHR15141 PTHR15141:SF40
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006351; transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G05140 : Transcription elongation factor (TFIIS) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g17990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024198
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G141500 - -
2 Sobic.009G006800 eukaryotic initiation factor iso-4F subunit p82-34, putative, expressed -
3 Sobic.005G174600 - -
4 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
5 Sobic.005G221200 - -
6 Sobic.010G137700 - -
7 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
8 Sobic.003G415800 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
10 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.005G148700 - -
12 Sobic.001G301100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
13 Sobic.002G049800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
14 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.006G276401 - -
16 Sobic.005G153500 - -
17 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G270600 - -
19 Sobic.001G323500 expressed protein -
20 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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