Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G039700.1
Synonym Sb09g003360
Functional annotation myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
UniProt A0A1B6P6D9
Pfam PF00249
Panther DB PTHR12374 PTHR12374:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01200 : Duplicated homeodomain-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g07650.1 : myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055377
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
2 Sobic.005G221200 - -
3 Sobic.005G148700 - -
4 Sobic.005G141500 - -
5 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.005G174600 - -
7 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
9 Sobic.006G276401 - -
10 Sobic.001G301100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.003G135201 - -
12 Sobic.009G006800 eukaryotic initiation factor iso-4F subunit p82-34, putative, expressed -
13 Sobic.005G147700 - -
14 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
16 Sobic.003G415800 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.010G137700 - -
18 Sobic.001G323500 expressed protein -
19 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
20 Sobic.005G146200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G148700--Sobic004G017700 Sobic005G141500--Sobic005G221200 Sobic005G141500--Sobic005G174600 Sobic005G141500--Sobic005G109900 Sobic005G141500--Sobic009G006800 Sobic005G141500--Sobic009G039700 Sobic005G141500--Sobic003G135201 Sobic005G141500--Sobic005G148700 Sobic005G141500--Sobic005G109800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic005G141500--Sobic010G137700 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G109900 Sobic005G174600--Sobic009G006800 Sobic005G174600--Sobic005G109800 Sobic005G174600--Sobic003G135201 Sobic005G174600--Sobic009G039700 Sobic005G174600--Sobic009G039500 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic005G174600--Sobic003G415800 Sobic009G039500--Sobic002G061200 Sobic009G039500--Sobic005G109800 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic005G109900 Sobic009G039500--Sobic005G174700 Sobic009G039500--Sobic005G174600 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic009G039700 Sobic009G039500--Sobic005G221200 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G109900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.