Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G061200.1
Synonym Sb02g005086
Functional annotation OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q9H8
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF142
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g35050.1 : OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
2 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
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4 Sobic.003G438300 - -
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6 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
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12 Sobic.005G221200 - -
13 Sobic.005G141500 - -
14 Sobic.005G149800 - -
15 Sobic.005G051700 - -
16 Sobic.002G212400 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
17 Sobic.002G010700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
18 Sobic.001G301100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
19 Sobic.003G135201 - -
20 Sobic.009G039900 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic002G061200--Sobic007G109400 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic002G061200--Sobic009G039500 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic002G061200--Sobic005G109800 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic002G061200--Sobic003G438300 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic002G061200--Sobic005G109900 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic002G061200--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic002G061200--Sobic005G174600 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic002G061200--Sobic010G195600 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic002G061200--Sobic009G039700 Sobic007G109400--Sobic002G061200 Sobic007G109400--Sobic009G039500 Sobic007G109400--Sobic003G438300 Sobic007G109400--Sobic005G109800 Sobic007G109400--Sobic010G195600 Sobic007G109400--Sobic005G109900 Sobic007G109400--Sobic005G174700 Sobic007G109400--Sobic005G174600 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic007G109400--Sobic005G051700 Sobic009G039500--Sobic002G061200 Sobic009G039500--Sobic005G109800 Sobic009G039500--Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic005G109900 Sobic009G039500--Sobic005G174700 Sobic009G039500--Sobic005G174600 Sobic009G039500--Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic009G039700 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic009G039500--Sobic005G221200 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200 Sobic003G438300--Sobic007G109400 Sobic003G438300--Sobic002G061200 Sobic003G438300--Sobic010G195600 Sobic003G438300--Sobic009G039500 Sobic003G438300--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic003G438300--Sobic005G153400 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic005G109800 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic003G438300--Sobic009G039900 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G109900 Sobic005G174600--Sobic009G006800 Sobic005G174600--Sobic005G109800 Sobic005G174600--Sobic003G135201 Sobic005G174600--Sobic009G039700 Sobic005G174600--Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic003G415800 Sobic010G195600--Sobic005G051700 Sobic010G195600--Sobic005G153400 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic010G195600--Sobic005G116000 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic010G195600--Sobic001G328900 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic010G195600--Sobic009G039100 Sobic010G195600--Sobic003G438300 Sobic010G195600--Sobic009G039900 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic010G195600--Sobic006G064700 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic010G195600--Sobic002G345400 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic006G276401
Octagon: transcription factors


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