Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G010700.1,Sobic.002G010700.3,Sobic.002G010700.2
Synonym Sb02g001140
Functional annotation peroxidase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1W0W1P5 , C5X7B5 , A0A1W0W1R7
Pfam PF00141
Panther DB PTHR31517 PTHR31517:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00430; peroxidase
Gene Ontology GO:0006979; response to oxidative stress GO:0004601peroxidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G37530 : Peroxidase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02440.1 : peroxidase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008263 , Zm00025a016745 , Zm00025a016238 , Zm00025a002622 , Zm00025a036127 , Zm00025a014309 , Zm00025a013443 , Zm00025a008264
Brachypodium PNT74092 , KQK21558 , KQK21559 , KQK04037 , KQK13060
Barley HORVU5Hr1G097270.5 , HORVU5Hr1G097270.2 , HORVU5Hr1G097270.3 , HORVU5Hr1G097270.4 , HORVU5Hr1G097270.6 , HORVU5Hr1G097270.7 , HORVU5Hr1G097260.1 , HORVU6Hr1G014050.2 , HORVU2Hr1G063460.5 , HORVU2Hr1G063460.4 , HORVU2Hr1G063460.3 , HORVU2Hr1G063460.2 , HORVU6Hr1G020950.1 , HORVU6Hr1G020950.2 , HORVU7Hr1G089310.2 , HORVU7Hr1G089310.3 , HORVU7Hr1G089310.1 , HORVU5Hr1G098630.5 , HORVU5Hr1G098630.4 , HORVU5Hr1G098630.3 , HORVU5Hr1G098630.2
Wheat TraesCSU02G062700 , TraesCS6A02G081700 , TraesCS5B02G405300 , TraesCS2B02G278500 , TraesCSU02G250800 , TraesCS5A02G400600 , TraesCSU02G134300 , TraesCS5D02G410500 , TraesCS2D02G260300 , TraesCS2A02G263500 , TraesCS6B02G109000 , TraesCS6B02G109000 , TraesCS5A02G400500
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cDNA sequences
Sobic.002G010700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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11 Sobic.005G147700 - -
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13 Sobic.005G125800 - -
14 Sobic.005G042300 expressed protein -
15 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
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19 Sobic.005G174600 - -
20 Sobic.005G173532 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic002G010700--Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic002G010700--Sobic005G109500 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic002G010700--Sobic005G174700 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic002G010700--Sobic007G109400 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic002G010700--Sobic002G061200 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic002G010700--Sobic009G039500 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic002G010700--Sobic003G438300 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic002G010700--Sobic005G146200 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic002G010700--Sobic004G198550 Sobic009G051101--Sobic005G109500 Sobic009G051101--Sobic002G010700 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic009G051101--Sobic005G125800 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic009G051101--Sobic005G042300 Sobic009G051101--Sobic005G146200 Sobic009G051101--Sobic007G109400 Sobic009G051101--Sobic003G438300 Sobic009G051101--Sobic005G174700 Sobic009G051101--Sobic002G061200 Sobic005G109500--Sobic009G051101 Sobic005G109500--Sobic002G010700 Sobic005G109500--Sobic005G125800 Sobic005G109500--Sobic005G042300 Sobic005G109500--Sobic005G146200 Sobic005G109500--Sobic007G109400 Sobic005G109500--Sobic003G438300 Sobic005G109500--Sobic005G174700 Sobic005G109500--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic007G109400--Sobic002G061200 Sobic007G109400--Sobic009G039500 Sobic007G109400--Sobic003G438300 Sobic007G109400--Sobic005G109800 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic007G109400--Sobic010G195600 Sobic007G109400--Sobic005G109900 Sobic007G109400--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic007G109400--Sobic005G174600 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic007G109400--Sobic005G051700 Sobic002G061200--Sobic007G109400 Sobic002G061200--Sobic009G039500 Sobic002G061200--Sobic005G109800 Sobic002G061200--Sobic003G438300 Sobic002G061200--Sobic005G109900 Sobic002G061200--Sobic005G174700 Sobic002G061200--Sobic005G174600 Sobic002G061200--Sobic010G195600 Sobic002G061200--Sobic009G039700 Sobic009G039500--Sobic002G061200 Sobic009G039500--Sobic005G109800 Sobic009G039500--Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic005G109900 Sobic009G039500--Sobic005G174700 Sobic009G039500--Sobic005G174600 Sobic009G039500--Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic009G039700 Sobic009G039500--Sobic005G221200 Sobic003G438300--Sobic007G109400 Sobic003G438300--Sobic002G061200 Sobic003G438300--Sobic010G195600 Sobic003G438300--Sobic009G039500 Sobic003G438300--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic003G438300--Sobic005G153400 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic005G109800 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic003G438300--Sobic009G039900 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G198550--Sobic004G017700
Octagon: transcription factors


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