Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G042300.1
Synonym Sb05g003500
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y522
Pfam -
Panther DB PTHR33527 PTHR33527:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13620 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g10320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.005G051700 - -
15 Sobic.003G438300 - -
16 Sobic.006G034275 - -
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18 Sobic.005G153400 - -
19 Sobic.002G143700 alpha-soluble NSF attachment protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G110000 LTPL151 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic005G042300--Sobic005G125800 Sobic002G277432 Sobic002G277432 Sobic005G042300--Sobic002G277432 Sobic005G176500 Sobic005G176500 Sobic005G042300--Sobic005G176500 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic005G042300--Sobic009G040100 Sobic008G120450 Sobic008G120450 Sobic005G042300--Sobic008G120450 Sobic010G274200 Sobic010G274200 Sobic005G042300--Sobic010G274200 Sobic009G073700 Sobic009G073700 Sobic005G042300--Sobic009G073700 Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic005G042300--Sobic007G062700 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G042300--Sobic005G109500 Sobic005G125800--Sobic005G042300 Sobic005G125800--Sobic002G277432 Sobic005G125800--Sobic005G176500 Sobic005G125800--Sobic009G040100 Sobic005G125800--Sobic008G120450 Sobic005G125800--Sobic010G274200 Sobic005G125800--Sobic009G073700 Sobic005G125800--Sobic007G062700 Sobic005G125800--Sobic005G109500 Sobic002G277432--Sobic005G176500 Sobic002G277432--Sobic008G120450 Sobic002G277432--Sobic009G073700 Sobic009G071900 Sobic009G071900 Sobic002G277432--Sobic009G071900 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic002G277432--Sobic005G140300 Sobic002G277432--Sobic005G042300 Sobic002G277432--Sobic005G125800 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic002G277432--Sobic005G110000 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic002G277432--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic002G277432 Sobic005G176500--Sobic008G120450 Sobic005G176500--Sobic009G073700 Sobic005G176500--Sobic009G071900 Sobic005G176500--Sobic005G140300 Sobic005G176500--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic005G110000 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic005G176500--Sobic010G237100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic005G176500--Sobic001G381250 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic009G040100--Sobic005G116000 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic009G040100--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic009G040100--Sobic005G153400 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic009G040100--Sobic010G195600 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic009G040100--Sobic005G153600 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic009G040100--Sobic001G328900 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic009G040100--Sobic007G205200 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G040100--Sobic003G438300 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic009G040100--Sobic005G199101 Sobic008G120450--Sobic009G073700 Sobic008G120450--Sobic002G277432 Sobic008G120450--Sobic005G176500 Sobic008G120450--Sobic009G071900 Sobic008G120450--Sobic005G110000 Sobic008G120450--Sobic001G381250 Sobic002G141450 Sobic002G141450 Sobic010G274200--Sobic002G141450 Sobic010G274200--Sobic005G042300 Sobic010G274200--Sobic005G125800 Sobic010G274200--Sobic002G277432 Sobic010G274200--Sobic005G176500 Sobic010G274200--Sobic009G040100 Sobic010G274200--Sobic008G120450 Sobic010G164100 Sobic010G164100 Sobic010G274200--Sobic010G164100 Sobic007G075301 Sobic007G075301 Sobic010G274200--Sobic007G075301 Sobic009G073700--Sobic008G120450 Sobic009G073700--Sobic009G071900 Sobic009G073700--Sobic005G176500 Sobic009G073700--Sobic002G277432 Sobic009G073700--Sobic001G381250 Sobic007G062700--Sobic005G140300 Sobic007G062700--Sobic006G034275 Sobic002G143700 Sobic002G143700 Sobic007G062700--Sobic002G143700 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic007G062700--Sobic010G153800 Sobic007G062700--Sobic005G199101 Sobic007G062700--Sobic005G176500 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic007G062700--Sobic005G225000 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic007G062700--Sobic010G142300 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic007G062700--Sobic005G187100 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G109500--Sobic009G051101 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic005G109500--Sobic002G010700 Sobic005G109500--Sobic005G125800 Sobic005G109500--Sobic005G042300 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G109500--Sobic005G146200 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic005G109500--Sobic007G109400 Sobic005G109500--Sobic003G438300 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic005G109500--Sobic005G174700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G109500--Sobic002G061200
Octagon: transcription factors


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