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Transcriptome id Sobic.009G051101.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R102
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G109500 cycloartenol synthase, putative, expressed -
2 Sobic.002G010700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.005G125800 - -
4 Sobic.005G042300 expressed protein -
5 Sobic.005G146200 - -
6 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
7 Sobic.003G438300 - -
8 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G198550 - -
11 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.010G274200 ZOS6-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
13 Sobic.009G040100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.005G147700 - -
15 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
17 Sobic.010G069800 cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
18 Sobic.005G221300 - -
19 Sobic.005G173532 - -
20 Sobic.010G195600 reductase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic009G051101--Sobic005G109500 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic009G051101--Sobic002G010700 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic009G051101--Sobic005G125800 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic009G051101--Sobic005G042300 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic009G051101--Sobic005G146200 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic009G051101--Sobic007G109400 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G051101--Sobic003G438300 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic009G051101--Sobic005G174700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic009G051101--Sobic002G061200 Sobic005G109500--Sobic009G051101 Sobic005G109500--Sobic002G010700 Sobic005G109500--Sobic005G125800 Sobic005G109500--Sobic005G042300 Sobic005G109500--Sobic005G146200 Sobic005G109500--Sobic007G109400 Sobic005G109500--Sobic003G438300 Sobic005G109500--Sobic005G174700 Sobic005G109500--Sobic002G061200 Sobic002G010700--Sobic009G051101 Sobic002G010700--Sobic005G109500 Sobic002G010700--Sobic005G174700 Sobic002G010700--Sobic007G109400 Sobic002G010700--Sobic002G061200 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic002G010700--Sobic009G039500 Sobic002G010700--Sobic003G438300 Sobic002G010700--Sobic005G146200 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic002G010700--Sobic004G198550 Sobic005G125800--Sobic005G042300 Sobic002G277432 Sobic002G277432 Sobic005G125800--Sobic002G277432 Sobic005G176500 Sobic005G176500 Sobic005G125800--Sobic005G176500 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic005G125800--Sobic009G040100 Sobic008G120450 Sobic008G120450 Sobic005G125800--Sobic008G120450 Sobic010G274200 Sobic010G274200 Sobic005G125800--Sobic010G274200 Sobic009G073700 Sobic009G073700 Sobic005G125800--Sobic009G073700 Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic005G125800--Sobic007G062700 Sobic005G125800--Sobic005G109500 Sobic005G042300--Sobic005G125800 Sobic005G042300--Sobic002G277432 Sobic005G042300--Sobic005G176500 Sobic005G042300--Sobic009G040100 Sobic005G042300--Sobic008G120450 Sobic005G042300--Sobic010G274200 Sobic005G042300--Sobic009G073700 Sobic005G042300--Sobic007G062700 Sobic005G042300--Sobic005G109500 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic007G109400--Sobic002G061200 Sobic007G109400--Sobic009G039500 Sobic007G109400--Sobic003G438300 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic007G109400--Sobic005G109800 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic007G109400--Sobic010G195600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic007G109400--Sobic005G109900 Sobic007G109400--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic007G109400--Sobic005G174600 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic007G109400--Sobic005G051700 Sobic003G438300--Sobic007G109400 Sobic003G438300--Sobic002G061200 Sobic003G438300--Sobic010G195600 Sobic003G438300--Sobic009G039500 Sobic003G438300--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic003G438300--Sobic005G153400 Sobic003G438300--Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic005G109800 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic003G438300--Sobic009G039900 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic002G061200--Sobic007G109400 Sobic002G061200--Sobic009G039500 Sobic002G061200--Sobic005G109800 Sobic002G061200--Sobic003G438300 Sobic002G061200--Sobic005G109900 Sobic002G061200--Sobic005G174700 Sobic002G061200--Sobic005G174600 Sobic002G061200--Sobic010G195600 Sobic002G061200--Sobic009G039700
Octagon: transcription factors


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