Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G274200.1
Synonym Sb10g030810
Functional annotation ZOS6-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt A0A194YLX0
Pfam PF13912
Panther DB PTHR26374 PTHR26374:SF181
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17180 : C2H2-like zinc finger protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g51140.1 : ZOS6-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021387 , Zm00025a039697
Brachypodium KQK15405 , KQK14433 , KQK16661 , PNT67863
Barley -
Wheat TraesCS7A02G548800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G141450 "TCP is actually a family of transcription factors named after: teosinte branched 1 (tb1, Zea mays (Maize)), cycloidea (cyc) (Antirrhinum majus) (Garden snapdragon) and PCF in rice (Oryza sativa)."(PubMedID : 27917941)@"plant-specific TCP family of transcription factors, in particular, have been shown to play key roles in evolution of plant form and structure (putative)"(PubMedID : 28383054) -
2 Sobic.005G042300 expressed protein -
3 Sobic.005G125800 - -
4 Sobic.002G277432 - -
5 Sobic.005G176500 DEFL14 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.009G040100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
7 Sobic.008G120450 - -
8 Sobic.010G164100 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
9 Sobic.007G075301 - -
10 Sobic.009G073700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G037300 cycloartenol synthase, putative, expressed -
12 Sobic.004G190200 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
13 Sobic.009G071900 LTPL31 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
14 Sobic.007G062700 zinc finger family protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G109500 cycloartenol synthase, putative, expressed -
16 Sobic.009G051101 - -
17 Sobic.004G294500 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.005G116000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.005G140300 expressed protein -
20 Sobic.005G051700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G274200 Sobic010G274200 Sobic002G141450 Sobic002G141450 Sobic010G274200--Sobic002G141450 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic010G274200--Sobic005G042300 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic010G274200--Sobic005G125800 Sobic002G277432 Sobic002G277432 Sobic010G274200--Sobic002G277432 Sobic005G176500 Sobic005G176500 Sobic010G274200--Sobic005G176500 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic010G274200--Sobic009G040100 Sobic008G120450 Sobic008G120450 Sobic010G274200--Sobic008G120450 Sobic010G164100 Sobic010G164100 Sobic010G274200--Sobic010G164100 Sobic007G075301 Sobic007G075301 Sobic010G274200--Sobic007G075301 Sobic002G141450--Sobic010G274200 Sobic004G294500 Sobic004G294500 Sobic002G141450--Sobic004G294500 Sobic002G141450--Sobic009G040100 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic002G141450--Sobic009G007500 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic002G141450--Sobic009G253800 Sobic004G190200 Sobic004G190200 Sobic002G141450--Sobic004G190200 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic002G141450--Sobic005G116000 Sobic002G141450--Sobic010G164100 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic002G141450--Sobic005G051700 Sobic005G042300--Sobic005G125800 Sobic005G042300--Sobic002G277432 Sobic005G042300--Sobic005G176500 Sobic005G042300--Sobic009G040100 Sobic005G042300--Sobic008G120450 Sobic005G042300--Sobic010G274200 Sobic009G073700 Sobic009G073700 Sobic005G042300--Sobic009G073700 Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic005G042300--Sobic007G062700 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G042300--Sobic005G109500 Sobic005G125800--Sobic005G042300 Sobic005G125800--Sobic002G277432 Sobic005G125800--Sobic005G176500 Sobic005G125800--Sobic009G040100 Sobic005G125800--Sobic008G120450 Sobic005G125800--Sobic010G274200 Sobic005G125800--Sobic009G073700 Sobic005G125800--Sobic007G062700 Sobic005G125800--Sobic005G109500 Sobic002G277432--Sobic005G176500 Sobic002G277432--Sobic008G120450 Sobic002G277432--Sobic009G073700 Sobic009G071900 Sobic009G071900 Sobic002G277432--Sobic009G071900 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic002G277432--Sobic005G140300 Sobic002G277432--Sobic005G042300 Sobic002G277432--Sobic005G125800 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic002G277432--Sobic005G110000 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic002G277432--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic002G277432 Sobic005G176500--Sobic008G120450 Sobic005G176500--Sobic009G073700 Sobic005G176500--Sobic009G071900 Sobic005G176500--Sobic005G140300 Sobic005G176500--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic005G110000 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic005G176500--Sobic010G237100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic005G176500--Sobic001G381250 Sobic009G040100--Sobic005G116000 Sobic009G040100--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic009G040100--Sobic005G153400 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic009G040100--Sobic010G195600 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic009G040100--Sobic005G153600 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic009G040100--Sobic001G328900 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic009G040100--Sobic007G205200 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G040100--Sobic003G438300 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic009G040100--Sobic005G199101 Sobic008G120450--Sobic009G073700 Sobic008G120450--Sobic002G277432 Sobic008G120450--Sobic005G176500 Sobic008G120450--Sobic009G071900 Sobic008G120450--Sobic005G110000 Sobic008G120450--Sobic001G381250 Sobic010G164100--Sobic007G075301 Sobic005G193260 Sobic005G193260 Sobic010G164100--Sobic005G193260 Sobic005G192700 Sobic005G192700 Sobic010G164100--Sobic005G192700 Sobic005G185600 Sobic005G185600 Sobic010G164100--Sobic005G185600 Sobic005G192900 Sobic005G192900 Sobic010G164100--Sobic005G192900 Sobic005G192901 Sobic005G192901 Sobic010G164100--Sobic005G192901 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic010G164100--Sobic010G044600 Sobic005G192801 Sobic005G192801 Sobic010G164100--Sobic005G192801 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic010G164100--Sobic002G362400 Sobic007G075301--Sobic010G164100 Sobic007G075301--Sobic005G193260 Sobic007G075301--Sobic005G185600 Sobic007G075301--Sobic005G192700 Sobic007G075301--Sobic005G192900 Sobic007G075301--Sobic005G192901 Sobic007G075301--Sobic005G192801 Sobic007G029800 Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic010G044600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.