Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G062700.1
Synonym Sb07g005010
Functional annotation zinc finger family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R8A4
Pfam PF14624 PF13768
Panther DB PTHR10579 PTHR10579:SF51
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08050 : Zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g03270.1 : zinc finger family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035563 , Zm00025a015470
Brachypodium KQK03828
Barley HORVU5Hr1G076190.1 , HORVU5Hr1G076190.2
Wheat TraesCS2B02G515000 , TraesCS3A02G393700 , TraesCS5B02G284200 , TraesCS2D02G459400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G392500 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic007G062700--Sobic005G140300 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic007G062700--Sobic006G034275 Sobic002G143700 Sobic002G143700 Sobic007G062700--Sobic002G143700 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic007G062700--Sobic010G153800 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic007G062700--Sobic005G199101 Sobic005G176500 Sobic005G176500 Sobic007G062700--Sobic005G176500 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic007G062700--Sobic005G225000 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic007G062700--Sobic010G142300 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic007G062700--Sobic005G187100 Sobic005G140300--Sobic006G034275 Sobic005G140300--Sobic010G142300 Sobic005G199300 Sobic005G199300 Sobic005G140300--Sobic005G199300 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic005G140300--Sobic005G223200 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic005G140300--Sobic009G010000 Sobic007G001600 Sobic007G001600 Sobic005G140300--Sobic007G001600 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic005G140300--Sobic005G110000 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic005G140300--Sobic003G392500 Sobic002G274900 Sobic002G274900 Sobic005G140300--Sobic002G274900 Sobic006G034275--Sobic005G140300 Sobic006G034275--Sobic010G142300 Sobic006G034275--Sobic005G223200 Sobic006G034275--Sobic009G010000 Sobic006G034275--Sobic003G392500 Sobic006G034275--Sobic005G199300 Sobic006G034275--Sobic007G001600 Sobic009G009900 Sobic009G009900 Sobic006G034275--Sobic009G009900 Sobic006G034275--Sobic002G274900 Sobic002G143700--Sobic006G034275 Sobic002G143700--Sobic010G142300 Sobic002G143700--Sobic005G140300 Sobic002G143700--Sobic005G223200 Sobic002G143700--Sobic003G392500 Sobic002G143700--Sobic009G010000 Sobic002G143700--Sobic005G199300 Sobic002G143700--Sobic007G001600 Sobic002G370300 Sobic002G370300 Sobic002G143700--Sobic002G370300 Sobic010G153800--Sobic005G199101 Sobic010G153800--Sobic005G225000 Sobic010G153800--Sobic005G187100 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic010G153800--Sobic002G091800 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic010G153800--Sobic002G344900 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic005G153600 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic010G153800--Sobic010G148600 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic010G153800--Sobic005G140400 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic010G153800--Sobic010G219300 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G219300 Sobic002G277432 Sobic002G277432 Sobic005G176500--Sobic002G277432 Sobic008G120450 Sobic008G120450 Sobic005G176500--Sobic008G120450 Sobic009G073700 Sobic009G073700 Sobic005G176500--Sobic009G073700 Sobic009G071900 Sobic009G071900 Sobic005G176500--Sobic009G071900 Sobic005G176500--Sobic005G140300 Sobic005G176500--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic005G110000 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic005G176500--Sobic010G237100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic005G176500--Sobic001G381250 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic010G142300--Sobic006G034275 Sobic010G142300--Sobic005G223200 Sobic010G142300--Sobic003G392500 Sobic010G142300--Sobic005G140300 Sobic010G142300--Sobic009G010000 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic010G142300--Sobic006G031600 Sobic010G142300--Sobic009G009900 Sobic010G142300--Sobic005G199300 Sobic010G142300--Sobic007G001600 Sobic005G187100--Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic005G199101 Sobic005G187100--Sobic005G225000 Sobic005G187100--Sobic010G219300 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic005G187100--Sobic007G082900 Sobic005G187100--Sobic002G091800 Sobic005G187100--Sobic002G344900 Sobic005G187100--Sobic005G153600 Sobic005G187100--Sobic010G148600
Octagon: transcription factors


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