Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G075301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R8H7 , P21925 , Q09198 , P21924
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02130 : low-molecular-weight cysteine-rich 68
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g11195.1 : gamma-thionin family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054858
Brachypodium KQJ95572
Barley HORVU5Hr1G083330.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G164100 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
2 Sobic.005G193260 "alpha-kafirin locus, highly digestible high-lysine (hdhl) mutant P721Q"(PubMedID : 23948869) -
3 Sobic.005G185600 - -
4 Sobic.005G192700 "alpha-kafirin locus, highly digestible high-lysine (hdhl) mutant P721Q"(PubMedID : 23948869)@- -
5 Sobic.005G192900 "alpha-kafirin locus, highly digestible high-lysine (hdhl) mutant P721Q"(PubMedID : 23948869)@- -
6 Sobic.005G192901 "alpha-kafirin locus, highly digestible high-lysine (hdhl) mutant P721Q"(PubMedID : 23948869) -
7 Sobic.005G192801 "alpha-kafirin locus, highly digestible high-lysine (hdhl) mutant P721Q"(PubMedID : 23948869) -
8 Sobic.007G029800 LTPL24 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.010G044600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.005G193100 "alpha-kafirin locus, highly digestible high-lysine (hdhl) mutant P721Q"(PubMedID : 23948869)@- -
11 Sobic.005G169300 WIP5 - Wound-induced protein precursor, expressed -
12 Sobic.001G381250 - -
13 Sobic.001G381250 - -
14 Sobic.001G381250 - -
15 Sobic.001G381250 - -
16 Sobic.001G381250 - -
17 Sobic.001G381250 - -
18 Sobic.001G381250 - -
19 Sobic.001G381250 - -
20 Sobic.001G381250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G075301 Sobic007G075301 Sobic010G164100 Sobic010G164100 Sobic007G075301--Sobic010G164100 Sobic005G193260 Sobic005G193260 Sobic007G075301--Sobic005G193260 Sobic005G185600 Sobic005G185600 Sobic007G075301--Sobic005G185600 Sobic005G192700 Sobic005G192700 Sobic007G075301--Sobic005G192700 Sobic005G192900 Sobic005G192900 Sobic007G075301--Sobic005G192900 Sobic005G192901 Sobic005G192901 Sobic007G075301--Sobic005G192901 Sobic005G192801 Sobic005G192801 Sobic007G075301--Sobic005G192801 Sobic007G029800 Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic007G029800 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic007G075301--Sobic010G044600 Sobic010G164100--Sobic007G075301 Sobic010G164100--Sobic005G193260 Sobic010G164100--Sobic005G192700 Sobic010G164100--Sobic005G185600 Sobic010G164100--Sobic005G192900 Sobic010G164100--Sobic005G192901 Sobic010G164100--Sobic010G044600 Sobic010G164100--Sobic005G192801 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic010G164100--Sobic002G362400 Sobic005G193260--Sobic005G192900 Sobic005G193260--Sobic005G192700 Sobic005G193260--Sobic005G192901 Sobic005G193260--Sobic005G192801 Sobic005G193260--Sobic005G185600 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic005G193260--Sobic001G381250 Sobic005G185600--Sobic005G192700 Sobic005G185600--Sobic005G192801 Sobic005G185600--Sobic005G192901 Sobic005G193100 Sobic005G193100 Sobic005G185600--Sobic005G193100 Sobic005G185600--Sobic005G192900 Sobic005G185600--Sobic005G193260 Sobic005G185600--Sobic007G029800 Sobic005G185600--Sobic001G381250 Sobic005G192700--Sobic005G192901 Sobic005G192700--Sobic005G192801 Sobic005G192700--Sobic005G192900 Sobic005G192700--Sobic005G193260 Sobic005G192700--Sobic005G185600 Sobic005G192700--Sobic005G193100 Sobic005G192700--Sobic001G381250 Sobic005G192900--Sobic005G193260 Sobic005G192900--Sobic005G192700 Sobic005G192900--Sobic005G192901 Sobic005G192900--Sobic005G192801 Sobic005G192900--Sobic001G381250 Sobic005G192901--Sobic005G192801 Sobic005G192901--Sobic005G192700 Sobic005G192901--Sobic005G192900 Sobic005G192901--Sobic005G193100 Sobic005G192901--Sobic005G185600 Sobic005G192901--Sobic001G381250 Sobic005G192801--Sobic005G192901 Sobic005G192801--Sobic005G193100 Sobic005G192801--Sobic005G192700 Sobic005G192801--Sobic005G192900 Sobic005G192801--Sobic005G185600 Sobic005G192801--Sobic001G381250 Sobic007G029800--Sobic005G185600 Sobic007G029800--Sobic005G192901 Sobic007G029800--Sobic005G192801 Sobic007G029800--Sobic005G193100 Sobic007G029800--Sobic005G192700 Sobic005G169300 Sobic005G169300 Sobic007G029800--Sobic005G169300 Sobic007G029800--Sobic001G381250 Sobic010G044600--Sobic002G362400 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic010G044600--Sobic005G110000 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic010G044600--Sobic010G237100 Sobic010G044600--Sobic005G169300 Sobic010G044600--Sobic005G192901 Sobic010G044600--Sobic005G192801 Sobic010G044600--Sobic005G193100 Sobic010G044600--Sobic001G381250
Octagon: transcription factors


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