Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G089600.1
Synonym Sb02g007410, PDF2.2, LCR69
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt C5X209
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02130 : low-molecular-weight cysteine-rich 68
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g03810.1 : DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G089600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.007G040500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic002G089600--Sobic004G198550 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic002G089600--Sobic005G147700 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic002G089600--Sobic005G221300 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic002G089600--Sobic007G205300 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic002G089600--Sobic005G146200 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic002G089600--Sobic009G039000 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic002G089600--Sobic006G276401 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic002G089600--Sobic004G017700 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic002G089600--Sobic005G133100 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G198550--Sobic004G017700 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic005G221300--Sobic004G198550 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G221300--Sobic007G040600 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G221300--Sobic002G250800 Sobic005G221300--Sobic002G089600 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic005G221300--Sobic008G126300 Sobic005G221300--Sobic007G205300 Sobic005G221300--Sobic005G146200 Sobic005G221300--Sobic005G133100 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic005G221300--Sobic004G076600 Sobic007G205300--Sobic005G133100 Sobic007G205300--Sobic002G089600 Sobic007G205300--Sobic004G198550 Sobic007G205300--Sobic007G040600 Sobic007G205300--Sobic005G082400 Sobic007G205300--Sobic005G221300 Sobic007G205300--Sobic009G039000 Sobic007G205300--Sobic005G147700 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic007G205300--Sobic004G048400 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic009G039000--Sobic007G047000 Sobic009G039000--Sobic004G017700 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic009G039000--Sobic007G109000 Sobic009G039000--Sobic005G082400 Sobic009G039000--Sobic005G133100 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic009G039000--Sobic005G074700 Sobic009G039000--Sobic005G147700 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic009G039000--Sobic007G040500 Sobic009G039000--Sobic006G276401 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic004G017700--Sobic009G039000 Sobic004G017700--Sobic005G148700 Sobic004G017700--Sobic007G109000 Sobic004G017700--Sobic005G147700 Sobic004G017700--Sobic006G276401 Sobic004G017700--Sobic005G074700 Sobic004G017700--Sobic007G047000 Sobic004G017700--Sobic005G221200 Sobic004G017700--Sobic005G082400 Sobic005G133100--Sobic004G048400 Sobic005G133100--Sobic007G040600 Sobic005G133100--Sobic007G040500 Sobic005G133100--Sobic005G082400 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic005G133100--Sobic005G212000 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic008G050300 Sobic005G133100--Sobic007G047000 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic008G135800 Sobic005G133100--Sobic009G039000
Octagon: transcription factors


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