Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G173532.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJQ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029449 , Zm00025a029452
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G147700 - -
2 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.004G198550 - -
4 Sobic.005G146200 - -
5 Sobic.006G276401 - -
6 Sobic.003G271600 Cupin domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.002G089600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
10 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.005G221200 - -
12 Sobic.005G148700 - -
13 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
14 Sobic.005G141500 - -
15 Sobic.002G010700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G174600 - -
18 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
19 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family


Gene co-expression network
sample Sobic005G173532 Sobic005G173532 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G173532--Sobic005G147700 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic005G173532--Sobic005G174700 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G173532--Sobic004G198550 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G173532--Sobic005G146200 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G173532--Sobic006G276401 Sobic003G271600 Sobic003G271600 Sobic005G173532--Sobic003G271600 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G173532--Sobic009G039700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G173532--Sobic002G089600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G173532--Sobic005G109900 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic004G198550--Sobic004G017700 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic003G271600--Sobic005G173532 Sobic003G271600--Sobic005G147700 Sobic003G271600--Sobic005G174700 Sobic003G271600--Sobic006G276401 Sobic003G271600--Sobic004G198550 Sobic003G271600--Sobic009G039700 Sobic003G271600--Sobic005G221200 Sobic003G271600--Sobic005G109900 Sobic003G271600--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic002G089600--Sobic004G198550 Sobic002G089600--Sobic005G147700 Sobic002G089600--Sobic005G221300 Sobic002G089600--Sobic007G205300 Sobic002G089600--Sobic005G146200 Sobic002G089600--Sobic009G039000 Sobic002G089600--Sobic006G276401 Sobic002G089600--Sobic004G017700 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic002G089600--Sobic005G133100 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G109900--Sobic003G135201
Octagon: transcription factors


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