Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G271600.1
Synonym GL22, Sb03g032370
Functional annotation Cupin domain containing protein, expressed
UniProt C5XHM0
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G02335 : germin-like protein subfamily 2 member 2 precursor
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g50900.1 : Cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027855
Brachypodium KQK09389
Barley -
Wheat TraesCS3D02G489700 , TraesCS3B02G543700 , TraesCS7D02G477200 , TraesCS3A02G040900 , TraesCS3B02G544200 , TraesCS3D02G490500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G271600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic003G271600 Sobic003G271600 Sobic005G173532 Sobic005G173532 Sobic003G271600--Sobic005G173532 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic003G271600--Sobic005G147700 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic003G271600--Sobic005G174700 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic003G271600--Sobic006G276401 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic003G271600--Sobic004G198550 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic003G271600--Sobic009G039700 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic003G271600--Sobic005G221200 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic003G271600--Sobic005G109900 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic003G271600--Sobic005G148700 Sobic005G173532--Sobic005G147700 Sobic005G173532--Sobic005G174700 Sobic005G173532--Sobic004G198550 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G173532--Sobic005G146200 Sobic005G173532--Sobic006G276401 Sobic005G173532--Sobic003G271600 Sobic005G173532--Sobic009G039700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G173532--Sobic002G089600 Sobic005G173532--Sobic005G109900 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic009G039500 Sobic005G174700--Sobic005G109900 Sobic005G174700--Sobic009G039700 Sobic005G174700--Sobic005G147700 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic002G061200 Sobic005G174700--Sobic005G221200 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic005G109800 Sobic005G174700--Sobic006G276401 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G174700--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic004G198550--Sobic004G017700 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic005G148700--Sobic004G017700
Octagon: transcription factors


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