Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G115900.2
Synonym AL6
Functional annotation PHD finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R343
Pfam PF00628
Panther DB PTHR12321 PTHR12321:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02470 : alfin-like 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g66420.1 : PHD finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G042300 expressed protein -
2 Sobic.005G125800 - -
3 Sobic.002G277432 - -
4 Sobic.005G176500 DEFL14 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.009G040100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
6 Sobic.008G120450 - -
7 Sobic.009G073700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G274200 ZOS6-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.007G075351 - -
10 Sobic.009G071900 LTPL31 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.005G109500 cycloartenol synthase, putative, expressed -
12 Sobic.009G051101 - -
13 Sobic.007G062700 zinc finger family protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G024700 MYB family transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.005G140300 expressed protein -
16 Sobic.005G116000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.005G051700 - -
18 Sobic.006G034275 - -
19 Sobic.002G010700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.003G438300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G115900 Sobic009G115900 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic009G115900--Sobic005G042300 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic009G115900--Sobic005G125800 Sobic002G277432 Sobic002G277432 Sobic009G115900--Sobic002G277432 Sobic005G176500 Sobic005G176500 Sobic009G115900--Sobic005G176500 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic009G115900--Sobic009G040100 Sobic008G120450 Sobic008G120450 Sobic009G115900--Sobic008G120450 Sobic009G073700 Sobic009G073700 Sobic009G115900--Sobic009G073700 Sobic010G274200 Sobic010G274200 Sobic009G115900--Sobic010G274200 Sobic007G075351 Sobic007G075351 Sobic009G115900--Sobic007G075351 Sobic005G042300--Sobic005G125800 Sobic005G042300--Sobic002G277432 Sobic005G042300--Sobic005G176500 Sobic005G042300--Sobic009G040100 Sobic005G042300--Sobic008G120450 Sobic005G042300--Sobic010G274200 Sobic005G042300--Sobic009G073700 Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic005G042300--Sobic007G062700 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G042300--Sobic005G109500 Sobic005G125800--Sobic005G042300 Sobic005G125800--Sobic002G277432 Sobic005G125800--Sobic005G176500 Sobic005G125800--Sobic009G040100 Sobic005G125800--Sobic008G120450 Sobic005G125800--Sobic010G274200 Sobic005G125800--Sobic009G073700 Sobic005G125800--Sobic007G062700 Sobic005G125800--Sobic005G109500 Sobic002G277432--Sobic005G176500 Sobic002G277432--Sobic008G120450 Sobic002G277432--Sobic009G073700 Sobic009G071900 Sobic009G071900 Sobic002G277432--Sobic009G071900 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic002G277432--Sobic005G140300 Sobic002G277432--Sobic005G042300 Sobic002G277432--Sobic005G125800 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic002G277432--Sobic005G110000 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic002G277432--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic002G277432 Sobic005G176500--Sobic008G120450 Sobic005G176500--Sobic009G073700 Sobic005G176500--Sobic009G071900 Sobic005G176500--Sobic005G140300 Sobic005G176500--Sobic006G034275 Sobic005G176500--Sobic005G110000 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic005G176500--Sobic010G237100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic005G176500--Sobic001G381250 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic009G040100--Sobic005G116000 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic009G040100--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic009G040100--Sobic005G153400 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic009G040100--Sobic010G195600 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic009G040100--Sobic005G153600 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic009G040100--Sobic001G328900 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic009G040100--Sobic007G205200 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G040100--Sobic003G438300 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic009G040100--Sobic005G199101 Sobic008G120450--Sobic009G073700 Sobic008G120450--Sobic002G277432 Sobic008G120450--Sobic005G176500 Sobic008G120450--Sobic009G071900 Sobic008G120450--Sobic005G110000 Sobic008G120450--Sobic001G381250 Sobic009G073700--Sobic008G120450 Sobic009G073700--Sobic009G071900 Sobic009G073700--Sobic005G176500 Sobic009G073700--Sobic002G277432 Sobic009G073700--Sobic001G381250 Sobic002G141450 Sobic002G141450 Sobic010G274200--Sobic002G141450 Sobic010G274200--Sobic005G042300 Sobic010G274200--Sobic005G125800 Sobic010G274200--Sobic002G277432 Sobic010G274200--Sobic005G176500 Sobic010G274200--Sobic009G040100 Sobic010G274200--Sobic008G120450 Sobic010G164100 Sobic010G164100 Sobic010G274200--Sobic010G164100 Sobic007G075301 Sobic007G075301 Sobic010G274200--Sobic007G075301 Sobic006G064400 Sobic006G064400 Sobic007G075351--Sobic006G064400 Sobic007G075351--Sobic001G381250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.